1.下载 2.读取暴露文件 2.1 使用TwoSampleMR获取MR base提供的数据 (要求网络状态良好,并且需要提前知道暴露的ID号,以体质指数为例,该暴露号为‘ie...
Seurat是单细胞分析经常使用的分析包。seurat对象的处理是分析的一个难点,这里我根据我自己的理解整理了下常用的seurat对象处理的一些操作,有不足或者错误的地方希望...
R语言中创建函数参数的问题 R可以很方便的指定任意长度的参数列表(…)可以表示将额外的参数传递给另外的一个函数 - 再有就是可以表示参数可变 举例说明 该计算会将 … 额外的...
R储存生信图片格式Orientation:landscape(横屏)
这是我学习jimmyB站的GEO数据挖掘-记下的笔记 视频直达:B站GEO数据挖掘 代码直达:github - jmzeng1314 了解GEO数据库 GSE,GSM,GPL...
第一步--类似教程学习 用到的包有:affyPLM,affy,RColorBrewer,immpute,limma,pheatmap,ggplot2 ReadAffy函数: ...
哇 探究的过程好厉害!!!一步步研究下去发现问题,解决问题,思路清晰,牛皮!
GEO数据分析中exprs提取表达矩阵,pData提取临床信息关于用getGEO下载数据后,会得到一个list,取出第一个列表中的元素后,再查看这第一个元素的数据类型后,发现他是一个对象("ExpressionSet"),然后我们就会用...
一.第一代测序 必备概念:ddNTP 双脱氧的核苷酸,可以被DNA聚合酶识别结合到DNA链上,但由于没有本来要用来和下一个核苷酸形成磷酸二酯键的氧,所以在它后面DNA链终...
安装R包步骤 1- 先配置下载镜像 三种方法:1)在Rstudio手动设置,但是这个是CRAN的镜像,如果要下载Bioconductor的包,这个镜像是没有办法用的。 为了保...
R包学习 安装加载 镜像设置 通过options()BioC_mirror检验Bioconductor的镜像 自定义CRAN和Bioconductor的下载镜像:option...
测序的世界很奇妙,不同的数据处理可能得出不同的结论,入门生信首先要做的就是了解你的数据还等什么?跟我一起来探索吧~ 测序原理: 早期如何测序呢? 如果给你这么一串珠子,让你统...
一.配置R的镜像 Bioconductor的镜像查询 1.切换镜像 tools-packages-change 切换的是CRAN的镜像!!!下载Bioconductor时无...