这是目前为止我看到过的关于ATAC-seq的最新综述,感兴趣的话值得一读。2020.4.22更新:我看到一个公众号也翻译了这篇文章,而且正好跟我这篇翻译是在同一天发表http...
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写在前面:今天突然想写这个教程,花了一下午看资料,其实我前面是有一些基础的,但是看的还是会很乱,所以想把这个包的脉络写一下,希望能够可以跟大家讨论一下并且自己以后使用这个包的...
Seurat对象中的Assay: ######################################################################...
由于公司网络IT屏蔽了酷狗音乐,本文介绍如何通过Crash的软件绕开公司策略组白名单,使用酷狗音乐客户端的流量转发功能继续愉快听歌。 电脑连接公司的网络,在公司上网策略组白名...
热图(Heatmap)作为展示基因表达模式最直观的工具。它经常用在分子生物学文章里(尤其是microarray, RNA-seq相关论文)直观地呈现多样本多个基因的全局表达量...
稀疏矩阵几乎产生于所有的大型科学工程计算领域,记录样本特征值的稠密矩阵中很多记录值都是0,由于0不携带信息,因此耗费空间存储0元素是很浪费资源的行为。而且很多计算只对非零元素...
在shell脚本中,find命令用于搜索给定目录下符合搜索条件的的文件或子目录,如命令var=$(find "$PWD" -name "*.tsv")表示搜索当前目录下的所有...
在使用Seurat时,经常需要对不同分类的样本在同一画布上进行可视化,可以非常方便地通过其DimPlot()函数的goupyby和spliby等参数实现,例如对照组和实验组,...
无论是单细胞、空间组还是ATAC的数据,有时由于下游分析的需求或可视化的需求,同时由于python的运算速度的优势,目前越来越多单细胞分析的工具开始在python环境下开发(...