发简信
IP属地：湖北
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互帮互助问答帖
虽然没有几个关注，但能看到这些笔记的应该都是同志们 有时候朋友的私信我可能看不到，我也不一定能解决。 群体遗传学方面、生信方面、R语言等等，如果...
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tar 打包和压缩文件
tar是 Linux/Unix 中的一个常用工具，用于创建和提取归档文件。tar的全称是 “tape archive”，它原本设计用于将文件存储...
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Sweepfinder2 检测正选择信号
SweepFinder2 使用一种基于Composite Likelihood Ratio (CLR)的方法来检测正选择。CLR 是一种统计量，...
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XP-CLR 检测不同种群间选择信号XP-CLR 的基本思想是利用不同种群的等位基因频率差异和连锁不平衡模式来识别选择信号。假设一个基因在种群 A 中经历了选择，而种群 B 没有，...
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OmegaPlus 检测正选择信号OmegaPlus是一个用于检测基因组数据中正选择痕迹的生物信息学工具。基于单倍型频率分布和重组事件检测选择信号，通过计算ω统计量（omega ...
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跟 Susan R. McCouch 学习单基因的进化分析基于 Susan R. McCouch 同期的两篇文献学习一下单基因的进化分析，一篇是发表在 PNAS 上关于水稻香味基因 BADH2 的分析，...
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基于 GetOrganelle 组装叶绿体基因组
GetOrganelle是一款由中国科学院昆明植物研究所的金建军和郁文彬两位老师共同开发的质体组装软件，主要用于从基因组测序数据中组装完整的细胞...
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samtools 一些使用命令
对 SAM 或 BAM 格式的文件进行快速的统计分析： samtools flagstat xx.bam 示例： 415088184 + 0 i...
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LTR finder 和 LTR_retriever 使用说明
LTRfinder是一个用于识别和分析基因组中长末端重复序列（Long Terminal Repeat, LTR）的工具。LTR是一种在许多真核...