虽然没有几个关注,但能看到这些笔记的应该都是同志们 有时候朋友的私信我可能看不到,我也不一定能解决。 群体遗传学方面、生信方面、R语言等等,如果...
参考文献:Minh, B. Q., Hahn, M. W., & Lanfear, R. (2020). New methods to calc...
Minigraph-Cactus 泛基因组流程由五个步骤组成,可以单独运行,也可以作为单个工作流一起运行。 1)Minigraph 结构变异图构...
1. 创建独立环境 conda create -n liftoff python=3.11conda activate liftoff 检查: ...
1、D-statistic ABBA–BABA(也常写成 D-statistic)是群体基因组学中用来检测基因流(introgression)或...
#!/usr/bin/perluse strict;use warnings;if(@ARGV != 3){ die "Usage: perl...
CLUES(Conditional Likelihood Under Evolutionary Scenarios)是一个用于推断单个位点在群体...
1、转换文件格式 从 VCF 文件转换为 relate 软件可以读取的 hap 格式: PATH_TO_RELATE/bin/RelateFil...
推荐一个 VCF 文件格式转换的脚本。 https://github.com/edgardomortiz/vcf2phylip 常见用法:将 V...