复现《cell》图表往期内容： 1、复现《Cell》图表：柱状图|添加分组注释|legend设置[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg5OT...
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复现Cell图表：双侧柱状图展示上下调GO富集结果 -
免疫细胞注释-3：B细胞scRNAseq免疫细胞注释： 免疫细胞注释-1：T细胞[https://www.jianshu.com/p/0127c9b380c9] 免疫细胞注释-2：髓系细胞[http...
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10X单细胞空间联合分析之cell2location的详细梳理又是周五，马上元旦，不知道大家打算怎么跨年呢？但是，今天还是工作日，我们还是要学习学习，不负韶华。 这一篇还是想详细梳理一下cell2location，包括算法以及代码的写法...
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跟着 Nat Med. 学作图 | GSVA+limma差异通路分析+发散条形图跟着 Nat Med. 学作图 | GSVA+limma差异通路分析+发散条形图 Lambrechts D, Wauters E, Boeckx B, et al. Phen...
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RNA-seq入门实战（八）：GSVA——基因集变异分析本节概览：1.GSVA简单介绍2.基因集的下载读取: 手动与msigdbr包下载3.GSVA的运行4.limma差异分析5.GSVA结果可视化：热图、火山图、发散条形图/柱形...
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R 数据可视化 —— circlize 圆形热图前言 在前一节，我们介绍了如何使用 circos.rect() 函数来绘制圆形热图，在 0.4.10 版本之后，circlize 包提供了 circos.heatmap() ...
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从TCGA数据库下载并整合清洗高通量肿瘤表达谱-临床性状数据测序上游分析系列： mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw r...
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TCGA数据差异分析后生存分析（批量单因素cox回归/Lasso筛选，多因素cox建模，时间依赖ROC曲线及KM plot可视化）测序上游分析系列： mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw r...
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tSNE和UMAP的区别
这一篇是我的学习笔记，先附上学习链接：https://mp.weixin.qq.com/s/qkbc1vz-ERHzGp8gfLiVsg 首先，这是两种降维的scRNA-se...
