在单细胞研究中,最重要的一个环节就是细胞类型注释,这是一个极其考验研究者研究背景和精力的工作,但随着单细胞的研究越来越多,可提供给我们的细胞类型的marker信息也越来越丰富...
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前言 我们知道,细胞间信息传递方式一个是细胞表面配受体的相互作用,另一个通过细胞产生的可溶性小分子,即细胞因子。在单细胞数据分析中下游,有时候我们想看某几种细胞类型之间的相互...
你好!这套代码到2023年5月再运行的时候有好几处报错,改怎么解决?
完整的单细胞分析流程——理解你的单细胞分析之数据结构背景介绍 Bioconductor项目的主要优势之一在于使用通用数据基础结构,该数据基础结构可实现跨越R包的相互操作性。 用户应该能够使用来自不同Bioconductor软件...
Compiled: May 23, 2023 设置Seurat对象 对于本教程,我们将分析来自10X Genomics的一个外周血单个核细胞(PBMC)数据集。该数据集包含2...
太开心啦!谢谢小洁老师的鼓励!之前自己学的不踏实,虽然做了很详细的笔记,没有及时的复习和真正去理解每个代码的意思,老师的精髓还没学到,还得好好努力!
ICGC临床信息(生存信息)的整理yuxuan ICGC数据下载、表达矩阵整理相关内容详见小洁老师“生信星球”公众号的推文《ICGC数据下载和整理》,本整理过程也会用其整理的数据,详见: https://mp...
@小洁忘了怎么分身 谢谢老师的指导,我试试。
ICGC临床信息(生存信息)的整理yuxuan ICGC数据下载、表达矩阵整理相关内容详见小洁老师“生信星球”公众号的推文《ICGC数据下载和整理》,本整理过程也会用其整理的数据,详见: https://mp...
ICGC数据下载和整理 1.数据下载 https://dcc.icgc.org/[https://dcc.icgc.org/] https://dcc.icgc.org/re...
小洁老师,前一阵子用了好长时间整理ICGC中RECA-EU的数据,仔细学习了一下老师的代码,比我之前自己整理的简洁好用多了,我把生存信息的整理代码也重新整理了一下。这是链接:https://www.jianshu.com/p/4253a78d806b
ICGC数据下载和整理ICGC数据下载和整理 1.数据下载 https://dcc.icgc.org/[https://dcc.icgc.org/] https://dcc.icgc.org/re...
yuxuan ICGC数据下载、表达矩阵整理相关内容详见小洁老师“生信星球”公众号的推文《ICGC数据下载和整理》,本整理过程也会用其整理的数据,详见: https://mp...
GSE162631,4个胶质瘤样本,总计5万多个细胞。Seurat+CCA整合+singleR跑了跑。
真的是很细节,看了前几个细节感觉好熟悉,越往后看就更加确定了你是我们的“学长/学姐”。这里面的笔记还有很多事延伸的,很受用,总结的特别好。向优秀学员学习!
R语言细节汇总运行脚本的快捷键:cmd+enter (mac) 工作目录是指脚本、数据、图片的默认保存位置,也是文件读取的默认位置。我们使用project来管理工作目录 开始一个新的R语言...