发简信
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DimPlot散点图解决颜色叠加问题问题： 有时候拿到的样本的UMAP图形如下：灰色的细胞点多于紫色的细胞点，显示的结果都是都一个样本的细胞 针对以上问题DimPlot有个参数：s...
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单细胞细胞定义单细胞细胞定义合集 对于单细胞数据细胞分群的定义，一直是困惑大家的工作。对一直从事单细胞数据分析的工作人员，细胞定义非常简单；但是新手小白来说还...
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利用ggplot2绘制SCI样式的UMAP图Seurat包展示出来的umap/tsne图都是带有横纵坐标，基于Seurat包可能比较难调整图片的样式，只能借助AI或者PS处理图片。这次借助...
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单细胞SRR数据拆分
10X单细胞转录组测序数据的 SRA转fastq fastq-dump SRA转fastq 参考链接：10X单细胞转录组测序数据的 SRA转fa...
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ggplot2 金字塔图形（双向柱状图）这篇文章主要是分享一下金字塔图形的绘制方法，其来源是文章中的图E，如下： 看了一下，可以通过ggplot2来实现，数据来自于自己试验的数据（该数...
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Shell脚本循环读取文件内容,文件列表和配置文件
1、使用for循环 -文件内容 or 2、使用for循环 -文件名称 or 3.使用while循环 -文件名称 4.使用source循环 读取配...
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R-如何在图表左侧的pheatmap中显示行名？问题 我正在使用R中的pheatmap包制作热图。默认情况下，行名显示在热图的右侧。有谁知道如何将它们移到左侧？ 其他一些软件包似乎对此具有功能...
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FASTA和FASTQ
FASTA FASTA文件主要由两个部分构成：序列头信息（有时包括一些其它的描述信息）和具体的序列数据。头信息独占一行，以大于号（>）开头作为识...
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CellRanger网页报告浅蓝色部分下面的内容是从10X cellranger 官网里面看到的关于cellranger3.0以后的版本网页报告中的浅蓝色部分如何计算得到的讲解。 C...