为什么有的基因组拼不出来？为什么有的突变二代测序永远看不见？答案可能藏在‘读长’里。 在生命科学领域，测序技术的发展就像计算机芯片一样日新月异。从最早的一代测序（Sanger...
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一文读懂三代测序 ：PacBio 与 Nanopore
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refTSS：为转录起始位点精准“定位”的数据库
转录从哪里起始？答案是——在转录起始位点（TSS）。TSS 不只是一个位置符号，它把转录本、启动子、转录因子结合、染色质状态这些信息连成一条线。 在基因表达调控的研究中，转录...
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ROSE 软件挖掘「超级增强子」实战与代码分享
一、ROSE 软件是什么？----------------- ROSE 软件挖掘「超级增强子」实战与代码分享================================...
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超级增强子：基因调控的"黑匣子"1. 超级增强子介绍 超级增强子的概念于2013年由美国学者Richard A. Young及其团队首次提出[https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/art...
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Ensembl数据库|常用基因组数据库介绍在现代生命科学研究中，基因组数据 已成为不可或缺的资源。无论是基础研究还是转化医学，如何快速、准确地获取并解析基因组信息，直接决定着科研效率。在众多基因组数据库中，Ensem...
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快速发SCI，就选神刊：Sci！今天，发现了一个期刊，他叫Sci。如果你也想快速发SCI可以了解下MDPI旗下的神刊：Sci。期刊官网：https://www.mdpi.com/journal/sci[ht...
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Bioconductor：助力你的生物信息学研究在当今生物信息学飞速发展的时代，如何快速找到适合自己的分析工具、获取最新的技术资源，成为了每位研究者都关心的问题。今天要向大家介绍的是生物信息学领域的重要资源网站——Bioc...
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MEGA：新版本12发布！分子进化与系统发育分析软件的强大升级，计算更快更智能！随着分子进化与系统发育研究的快速发展，对高效、准确的软件工具需求日益增加。2024年12月10日，备受瞩目的MEGA软件迎来了最新版本——MEGA12！相关文章于当日上线bi...
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基因序列到进化树：轻松掌握多物种DNA序列比对与进化分析
基因序列的多物种比对与进化分析是研究物种间遗传关系和功能保守性等的关键步骤。今天，我们将以T2R41基因为例，手把手教大家如何下载基因序列、进行多序列比对，以及构建分子进化树...
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MEGA:多序列比对软件的下载与安装在生物信息学研究中，多序列比对是解析生物序列功能和进化关系的重要工具之一。而 MEGA (Molecular Evolutionary Genetics Analysis) ...
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ESPript：轻松绘制多序列比对结果，打造出版级Figure！在上一期文章中，我们介绍了如何在线高效完成蛋白序列比对，并获得了 .fasta 或 .fa 格式的比对结果文件。本期，我们将通过 ESPript 工具，将这些比对结果转换成清...
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个人自用，不喜勿喷
2021-09-24 qiime2 DADA2 去噪、序列质控和生成特征表
文字转载 DADA2是用于检测和校正（如果有可能的话）Illumina扩增序列数据的工作流程。正如在q2-dada2插件中实现的，这个质量控制过程将过滤掉在测序数据中鉴定的任...
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@今年你还可以修改亿次昵称 ？？？？
2021-09-24 qiime2 DADA2 去噪、序列质控和生成特征表
文字转载 DADA2是用于检测和校正（如果有可能的话）Illumina扩增序列数据的工作流程。正如在q2-dada2插件中实现的，这个质量控制过程将过滤掉在测序数据中鉴定的任...
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快速在线完成多物种蛋白序列比对及进化树构建！一文教你快速完成多物种蛋白序列比对及进化树构建！ 当我们研究一个蛋白时，探索其在不同物种间的保守性很关键。这不仅能帮助我们理解蛋白的功能和进化历史，还能为进一步实验设计提供线...
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安装VMware Tools ：优化 Ubuntu 使用体验在上一期教程中，我们在 VMware 虚拟机中成功安装了 Ubuntu 系统。然而，许多朋友可能会发现，新安装的 Ubuntu 系统在使用过程中存在一些小问题，比如屏幕边缘有...
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从虚拟机到Ubuntu系统：全面配置教程，带你轻松上手Linux
上期我们一起下载并安装了VMware，您的电脑里已经有了虚拟机，现在我们一起来为虚拟机配置Linux环境。 这里我们选择使用Ubuntu桌面版系统。ubuntu系统是一个以桌...
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初入Linux：虚拟机从下载到安装的全面教程
VMware Workstation介绍 VMware Workstation 在生物信息学中常用于模拟操作系统环境，例如在 Windows 上运行 Linux 系统以支持特...
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组织特异性基因怎么确定？TissueEnrich包帮你上期我们介绍了TissueEnrich包的安装方法以及对人鼠的基因列表进行组织特异性基因富集分析，本期我们来学习 TissueEnrich 包如何鉴定组织特异性基因，本期主要...
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TissueEnrich：基因集的组织特异性富集分析R包
科研数据分析中，如何知道你的差异基因或得到的基因列表富集在什么组织中？今天分享的TissueEnrich包可以轻松帮你解答这个问题。我们一起来学习一下这个R包。 Tissue...
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超全！R语言数据和图像导出的12种方法上一期我们介绍了R语言数据读取的方法，这期我们一起全面了解下R语言的数据与图像输出的方法。在数据分析和可视化过程中，输出数据和图像至关重要。R语言提供了丰富的函数和包，用于导...