越来越懒了,不想写记录呀!算了,强迫自己一把! 水平有限,若有错误,恳请指出! 信使RNA ( messenger RNA, mRNA)加工过程中的精细调控对基因的表达具有重...
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序 言 ChIPseeker用来注释peak确实很方便,也内置了不少的可视化函数可以用来展示结果。ChIPseeker基于annotatePeak函数做注释虽然使用起来很...
以Pacific Biosciences (PacBio)公司为代表的第三代单分子实时荧光测序平台为以测序为基础的科学研究带来了革命性的突破。目前该技术广泛应用于基因组Den...
1、minimap2 Minimap2 is a fast sequence mapping and alignment program that can find over...
一、Minimap2 使用 官方网站:https://github.com/lh3/minimap2[https://github.com/lh3/minimap2] 1. ...
关于查找motif,目前有很多种软件可以进行预测。我所在的实验室通常使用FIMO(MEME套件里的一个),但是有很多文献里也提到了HOMER这个软件,并且不乏一些影响因子很高...
刘宋宗室残杀现象屡见不鲜,清人汪中《补宋书宗室世系表序》称刘宋刘氏年中,皇族一百廿九人,被杀者百廿一,骨肉相屠害者八十人。据清代罗振玉《补宋书宗室世系表》统计,皇族一百...
法一: 安装: sudo apt install mysql-client-core-5.7sudo apt install mariadb-client-core-10.1...
转座子数据库 上一篇《TEtranscripts:转座子元件差异表达[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkzODI1MjYyNA==&...
归纳几篇eQTL相关文章。 1.转自https://www.cnblogs.com/Acceptyly/p/3904108.html 首先QTL是数量性状位点,比如身高是一个...
前几天学习了文献CUT&Tag[https://www.jianshu.com/p/335aec753039],了解了原理以后,可以跟着官网来学习如何分析CUT&Tag数据了...
0.安装R包 1.下载数据,提取表达矩阵和临床信息 检查数据下载的完整性看两个KB或MB大小是否一样 2.分组信息&探针注释 当一列中一部分相同,一部分不相同,取不同部分时 ...
##根据DAVID结果做图GOterm分析,数据格式从DAVID中下载,先保存至txt,后用excel打开,再保存为CSV格式 x<-read.csv(file = "C:\...
前情提要 搞NGS,注释文件是我们经常需要用到的。但是不同的实验室偏爱的数据库各不相同,甚至同一个课题组的小伙伴都会选择不同来源的数据库。那么不同来源的数据库是否有什么不同呢...
在开始笔记之前我只想吐槽一下,官网里这一部分的代码错的离谱!!!各种报错报的我怀疑人生。。。 第四节 比对结果过滤和文件格式转换 (一)利用比对质量过滤比对上的【可选步骤】 ...
100G 数据过滤 10个线程 不到1个小时 已经算可以了 关掉dup计算功能还会快
番茄工作法,一直耳闻,从未实践过。之前预习迎考,时有动力不足、精力不集中等状况发生,效率低下,一天时间不知不觉就过去。而且对于实际的复习时间没有把握,不知道时间丢到哪里去了,...