最近有小伙伴私信我，如下的单细胞UMAP图怎么做？是啥样的图呢？就是UMAP图上其他群是灰色的，只有某个群或者某几个群是标记颜色的，比较突出。其实很简单，一种办法可参考我们之...
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单细胞UMAP图只标记特定细胞群、圈定细胞群及坐标轴修改
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满足你的硕士毕业论文小套路---蛋白结构与功能和疾病关系的生信分析完整套路
目前，许多学校的硕士毕业论文要求都是发表一篇中文核心论文，便能达到毕业小论文考核。针对小论文的发表，有的同学要么是因为课题难度有些大，没有摸好合适的浓度，实验结果不理想。...
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单细胞测序（sc-RNA seq）分析：Seurat4.0系列教程、高级分析、文章复现
时代的洪流奔涌而至，单细胞技术也从旧时王谢堂前燕，飞入寻常百姓家。雪崩的时候，没有一片雪花是无辜的，你我也从素不相识，到被一起卷入单细胞天地。R语言和Seurat已以势如破竹...
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单细胞数据中到底应该如何处理线粒体基因
什么是线粒体基因 线粒体是参与细胞凋亡启动和执行的主要细胞器之一。线粒体基因在大多数细胞中表达，其表达水平是细胞类型特异性的。也就是说这个也是和细胞类型及其状态有关系的。 为...
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转录组学习七（差异基因分析）
转录组学习一（软件安装） 转录组学习二（数据下载） 转录组学习三（数据质控） 转录组学习四（参考基因组及gtf注释探究） 转录组学习五（reads的比对与samtoo...
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1.转录组 | 上游分析（数据下载，比对，计数）参考：转录组分析记录； 转录组入门和进阶以下内容为转录组全部的上游分析，包括下载数据、比对、计数得到表达矩阵。https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo...
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转录组RNA-SEQ上游分析2020安装配置conda 使用清华源下载sh脚本并安装 下载完成后直接运行脚本文件bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh。需要输入yes然后等...
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RNAseq007 转录组入门上游分析全流程
传送门： RNAseq006 转录组入门(6)：reads计数RNAseq005 转录组入门(5)：序列比对RNAseq004 转录组入门(4)：参考基因组下载RNAseq0...
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RNA-seq 数据分析最佳实战（综述）知识的学习没有一蹴而就，没有捷近，扎实的学习是唯一的捷近。 一篇RNA-seq分析流程的综述，全面而详细！深度好文，可用来反复阅读。初学者用于把握RNA-seq真个流程及各个...
