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小编导读 在基因组学研究进入泛基因组时代的今天,数据存储和处理效率成为制约大规模研究的关键瓶颈。想象一下,800万条SARS-CoV-2基因组序列只需要366 MB的存储空间...
【小编导读】 随着宏基因组学和病毒组学的快速发展,病毒基因组的数量呈指数级增长。如何对海量病毒基因组进行准确的分类学分类,成为病毒学研究的重要挑战。今天小编为大家介绍一款发表...
小编导读 随着单细胞多组学技术的快速发展,构建全面的人类免疫细胞图谱已成为理解免疫系统功能和疾病易感性的重要基础。然而,现有的大型免疫细胞图谱资源主要集中在欧洲人群,对亚洲人...
大家好!QIIME 2 2025年的第二个完整版本(2025.10)现已正式发布! 本次更新干货满满,不仅引入了全新的可视化整合报告功能,还对底层的框架和安全性进行了重要升级...
可能我们在文章中也有看到这种类似的进化树图,精确度可能只到门级别,常用于展示不同门或类群间的系统发育关系及相对丰度,也好奇这种图是怎么出的,今天就来简单探索下如何批量画出这种...
quickdraw是一种可扩展的方法,可以进行数量和二元性状的全基因组关联研究(GWAS)。研究人员将Quickdraws应用于405088个英国生物库样本的79个定量性状和...
大家好,今天小编分享一个亲测给力的生物信息学新工具——LexicMap。 🌟LexicMap是一个核苷酸序列比对工具,专为高效查询基因、质粒、病毒或长读长序列设计,能够应对高...
从2005年起,OBITools就开始了它的旅程,目标直指崭露头角的DNA元条形码技术。为了让工具模块化且易于扩展,OBITools的设计灵感来源于Unix命令行,就像是一系...
GPU工具分类 实话实说,暂时只有英伟达的GPU才能实现比较方便的基因组分析集成化解决方案,其他卡还需要努力呀,或者需要商业公司或学术团体的努力开发呀!FPGA等这种专用卡的...
分别是中国人群和东北亚人群的填充参考,测试了下,中国人群的参考注册还是相对友好的,没有像有些网站一样严格限制。东北亚的没有测试,两个数据库的特点都是包含了少数民族,研究朝鲜或...
最近学习祖源分析方面的内容,发现已经有了GPU版的软件,可以几十倍地加快运算速度,推荐使用!小数据集的话家用显卡即可hold住,十分给力!ADMIXTURE 是常用的群体遗传...
最近在qiime2论坛发现有人发布了qiime2宏基因组的教程,这里分享一下,只是alpha版本,不成熟,大家谨慎了解。qiime2的专用格式对于折腾宏基因组还是有点不妥的,...
feast团队的小幅更新之作,比较可惜的是由于发表的杂志影响不大,迄今引用只有个位数,相信这好酒香一定会飘出深巷子的。微生物源追踪分析已成为一种广泛的技术,用于表征复杂微生物...
笔记本型号是Redmi G2021,配置还凑活,5800H,16G, 3050Ti Laptop(4G VRAM),相当一般的配置啦!不过自从英伟达更新了驱动,可以实现RAM...
mummer2circos 是一个用于绘制细菌基因组的圈图(circos图)的工具。它基于 BLAST 或 NUCMER/PROMER 的比对结果,生成 SVG 和 PNG ...