感谢，避雷了属于是
NR数据库的下载最近想要用blast找一些同源蛋白，由于网站上的blast给出的信息实在是很难提取啊，萌生了入坑本地blast的想法，之前已经下载过blast本地软件了，因此这次需要用到的东...
IP属地：重庆
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生物信息小菜鸟记录遇到的问题，避免再次遇到的时候遗忘
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methylKit甲基化分析
引言 methylKit是一个R软件包，用于分析和注释通过高通量亚硫酸氢盐测序获得的DNA甲基化信息。该软件包旨在处理RRBS及其变体的测序数据。但是，如果提供正确的输入格式...
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论文研读：bioinfomatics|CGmapTools improves the precision of heterozygous SNV calls and supports allel...今天所读的论文题目是《CGmapTools improves the precision of heterozygous SNV calls and supports all...
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SSH超时断开(ClientAliveInterval和ClientAliveCountMax )的使用
问题详解：ssh远程登录centos系统，离开一段时间后，ssh窗口自动断开，有时会影响前台运行的任务，故而进行解决。1、我们编辑sshd_config文件。vim /etc...
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连雨不知春去，一晴方觉夏深
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用R语言对vcf文件进行数据挖掘.5 vcf可视化1目录 前言[https://www.jianshu.com/p/729673778e43] 方法简介[https://www.jianshu.com/p/d9bd081763...
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序列比对软件 MUMmer 结果文件解读（三）该系列主要介绍了 MUMmer 软件下核苷酸序列比对程序 nucmer 的使用，计算操作见前两篇推文； 序列比对软件 MUMmer 快速上手（一）[https://www.j...
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序列比对软件 MUMmer 简单上手（一）
MUMmer 4 是一个快速比对 DNA 或蛋白序列的软件，最常用的 program 就是 nucmer 和 promer，分别是比对核苷酸和氨基酸序列的，接下来以 nucm...
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序列比对软件 MUMmer 结果可读化处理（四）
关于该软件的计算可选参数以及结果文件的解读，见前三篇分享： 序列比对软件 MUMmer 快速上手（一）[https://www.jianshu.com/writer#/not...
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从零开始学CIRCOS绘制圈图(四)
通常circos的中间部分不是空白区域，会用一条条线进行连接，表示两个染色体部分区域有关系。 数据格式 对于link，circos要求输入数据至少有6列，分别是chr1 st...
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从零开始学CIRCOS绘制圈图(五)这一部分承接 从零开始学CIRCOS绘制圈图(四)，对之前的布局进行调整，使结构更加适合于发表。 染色体的位置顺序 默认情况下是会显示所有的染色体，而且会先从ath1到ath...
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从零开始学CIRCOS绘制圈图(二)在从零开始学Circos绘制圈图（一）我们已经绘制出一个比较丑的circos图，这一部分是讲解一些细节。 这一部分会从上一步的两个文件开始，分别是 karyotype.tai...
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基因 ID 和 Symbol 转换前言 看了这么多期的 circos，都有点乏了，换换口味也是好的。 下面，咱就开始吧。 做生信分析，总是免不了要给基因 ID 和 Symbol 转换来转换去。 方法 一般要进...
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R语言之数据合并、拆分、去重
上下简单合并 merge(df1, df2, all = T) dplyr的join系列合并数据框 library(tidyverse) —— 加载tidyverse包ful...
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ImageJ拼接显微镜图像拍照注意事项 首先图像在拍的时候要保证： 不变倍镜 不变焦 不改变曝光（手动曝光） 顺序拍照 连续两张照片之间保证至少1/2的图像重叠 同一组图像保存在同一个文件夹下 拼接图...
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【转载】不确定性原理本质上与量子力学无关，而是纯数学现象很多人认为，海森堡测不准原理（不确定性原理）是关于观察者通过光子与电子相互作用，从而影响光子的动量的理论。 观察者必须影响电子的动量（或某些量子状态）才能观察到它，这可能是真...
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生信 | circos文件准备大全（以拟南芥为例）一、写在前面 扣扣群：559758504（目前无需验证，一键即可加入） 如果你不想学，老板又催着要，你可以加群私聊我寻求帮助( $ _ $ )，但还是自己学，知识都是自己的。...
