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MOVICS包导入数据步骤 可以看出,brca.tcga中有以下几个数据集 从sapply函数中可以看出几个数据集行可不同,但列相同。那我们看看...
安装MOVICS代码devtools::install_github("xlucpu/MOVICS")但这个包非常复杂,安装时遇到了好些报错,解...
R语言有多种包可以画ROC曲线,如比较出名的有ROCR包,pROC包等。如有2个以上变量,则可单独画在一张图上,也可以变量为单位分开画。下面主要...
生成circ 最后画图 bubble图
本文主要目的是确定筛选的差异基因主要富集在哪些细胞中,可查看官方protocol https://github.com/NathanSkene/...
文献:Two gene co-expression modules differentiate psychoticsand controls网址...
Vector 向量—一维
dds <- DESeqDataSetFromMatrix(countData = exprSet,colData = colData, des...
结论:1.学术界已经不再推荐RPKM、FPKM; 2.比较基因的表达丰度,例如哪个基因在哪个组织里高表达,用TPM做均一化处理; 不同组间比较,...