2018年8月份的时候，我也使用过seurat来分析单细胞测序数据，然后最近也需要使用seurat包来分析实验室的单细胞测序数据，在R中安装完seurat的包后，我到网站上下...
发简信
IP属地：浙江
-
Official release of Seurat 3.0的学习过程 -
TCGA数据整合后进行DESeq2差异表达分析和基于R的多种可视化测序上游分析系列： mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw r...
-
TCGA-mRNA的生存分析引言：本文主要记录mRNA生存分析过程中遇到的问题以及具体过程，生存分析用的是最常见的KM法Kaplan-Meier。 工具：TCGA的数据通过library(TCGAbio...
-
可视化文章集锦(套路、配色、编辑、在线工具、R、CIRCOS、Cytoscape)
数据可视化是解析、理解和展示数据不可缺少的一部分。炫或不炫看个人喜好和功底，能否达意是最基本的要求---最合适的图示和配色表达最直观的含义。 本文整理了关于可视化套路 (什么...
-
2019第19周：运来的冬天
如题，这当然是要模仿《华为的冬天》的口气了。 你是否想过，如果有一天，你的工作随随便便有个年轻人就可以轻松替代，家里某个老人突然重病，以你收入以及存储之低，猎头的估价之低，你...
-
【r<-方案】TCGA barcode（样本ID）以及重名过滤我之前在简书上转载过别人写的TCGA barcode介绍，这两天碰到相关的问题，我看了看，觉得不是很清晰，再说道说道。 接触和分析过TCGA数据的朋友肯定会经常处理TCGA ...
-
2019-07-13 - TCGA胃癌的miRNA成熟体在肿瘤不同级别的表达图 (R)思路 首先要依据临床特征建立分组，无论是复发vs原发还是TNM分型中的T/N/M。将肿瘤每个样本的表型特征，与表达数据矩阵一一对应到同一张表格里来，随后再用作图工具出图。因为...
