很多时候遇到的数据均为表达谱数据,所以基因数量很多,需要用lasso回归来筛选变量。一般都是使用R来实现,下述代码为筛选变量与筛选出来的变量做ROC曲线 有很多时候需要得到一...
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目前富集很多都是用Y叔的clusterprofier,或者使用GSVA,ssGSEA,但是是否还有其他的富集方式,实际上还是有的,不过中文的介绍很少,所以这活只能我来干了。。...
-不删掉unknow,空白等改为unknow-Age:分为<=65和>65两组-Grade:GX改为unknow-Stage:Stage IA和Stage IB均改为Stag...
随着数据挖掘的高涨,大量ceRNA网络的文章不断涌现,感觉好像要烂大街的节奏,但仔细阅读ceRNA的相关文章还是有一定的参考价值的。下面来学习下这篇文章 发表杂志:Front...
解读文献题目: TCGA based integrated genomic analyses of ceRNA network and novel subtypes reve...
相信很多做科研的同学刚步入科学殿堂的时候,都是从学习和模仿他人的研究开始的,小编当年也是这样的。俗话说他山之石可以攻玉,这也是一种不错的学习方法。但是,有时候却很难重现原作者...
开门见山,直接上图 TCGA barcode 是TCGA项目中生物样本数据的主要标识符,接触过TCGA数据的人想必对这一串由数字、字母和短横线所组成的字符并不陌生,那么这一串...