基因类型鉴定 基因组的组装和注释完成，得到配套的基因组和注释文件之后，可以利用gffread软件提取对应的gene的cds，pep序列。应运而生，下游的生信或者实验想知道关注...
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「基因组」基因组分析之鉴定基因类型 -
如何用WGDI进行共线性分析(中)
Ks可视化 我们在上一篇如何用WGDI进行共线性分析(一)[http://xuzhougeng.top/archives/comparative-genome-analysi...
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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WGD（全基因组复制）分析——Ka/Ks及4Dtv值计算一、4Dtv（四倍简并位点颠换率）的定义 4DTV stands for four-fold synonymous (degenerative) third-codon tr...
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有关富集分析各种表和图怎么看的问题富集分析可以绘制很多不同的图形和两种结果表 一、两种结果表 1、GO富集分析结果以及表头各列的含义如下： 1）ONTOLOGY：表示GO分类的种类，通常有三个主要的类别： ①...
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比较基因组学分析3：特异节点基因家族富集分析（非模式物种GO/KEEG富集分析）比较基因组学分析目录 1：单拷贝基因构建物种树以及计算分化时间[https://www.jianshu.com/p/10bb4410ae3d]2：基因家族收缩与扩张分析[ht...
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请问如果想要分别提取一级质谱和二级质谱，是不是在MS Levels那里分别设置1-和2-呢，还是能一次性提取两个呀
【ProteoWizard MSConvert】质谱文件格式简介及其转换
质谱格式 质谱文件格式多种多样，各仪器厂商产出的数据都有不同。虽然HUPO已经对质谱数据进行了标准化，但大家依然是我行我素，因为不得不用它们提供的软件，而不同的软件会要求不同...
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教程 | 使用 CPGAVAS2 进行叶绿体基因组注释写在前面 前述，介绍了使用 GetOrganelle 软件进行植物叶绿体基因组组装。测试了下软件，130个样品，直接成环的有76个。手动调整了参数，除了 10 个左右的样品外...
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2024-01-30
Markdown语法 Markdown语法块元素标题引用列表任务列表代码块数学公式块表格脚注水平线目录Span元素链接内部链接参考链接URL网址图片强调/斜体粗体代码删除线（...
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利用Geneious对叶绿体基因组进行注释及查看使用软件：Geneious目的：对组装好的叶绿体基因组进行注释，注释好后进行查看，无误后绘制圈图 【注释部分】 1.首先从NCBI上下载一段与要注释的物种（目标序列）同源的物...
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一文讲完叶绿体基因组比较分析的全部软件和配套ggplot绘图脚本前段时间，发表了一篇叶绿体基因组比较分析文章。尽管这类套路文已经不再热门，但在准备数据分析的过程中，仍感各种资料教程之零散，各种文章的做图工具也是令人眼花缭乱。故此，列出个人...
