CytoTRACE2是一个新颖的深度学习框架,旨在处理单细胞潜能评估的复杂性,同时实现直接的生物学可解释性。该框架的核心是一组基因集二进制网络 (Gene Set Binar...

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MultiQC作为NGS数据QC报告的整合工具,目前已支持165个生信工具的报告整合,一键就可以轻轻松松将多样本的QC结果整合起来并生成网页报告,不仅省时省力还方便查看,解决...
CellRank是由出品scanpy的Fabian J. Theis 团队开发的单细胞轨迹分析工具,主要用于推断细胞命运的动态变化。传统轨迹推断 (trajectory in...
单细胞分析前期很重要的一步是细胞类型注释,这一步看似很简单,有时候做起来却是最耗时的一步。如果数据很好,用经典的或者文献里的marker很轻松就可以定义出细胞类型,此时这一步...
用scanpy做差异分析的时候,发现一个奇怪的现象,如果指定了reference参数,即使设置了pts参数来计算基因的在细胞群里面的表达比例,当提取差异结果的时候会发现并没有...
最近被bwa-mem -T参数搞迷糊了,不明白这个参数是如何发挥效用的。根据软件帮助文档对参数的描述,可知其功能是过滤输出结果,于是乎想当然地觉得它的作用是过滤掉alignm...
最近需要分析CNV,所以学习了一下cnvkit软件。不得不说,软件的文档写得真的很详细,能够感受到给予使用者的满满诚意。无论是最新的文档,还是网上相关的帖子,都会看到下面的这...