汪汪队队长_莱德

由于太久没有分析过bulk数据了，前几天突然被要求分析一个文章的数据时有点乱了手脚，所以在这里想总结一下关于芯片数据与seq数据的差异分析流程。 假如你是小白，也刚刚了解NG...

Clariom

在肿瘤研究领域，biomarker的研究以及相应试剂盒的开始，是服务于肿瘤临床的一个方向。这类研究项目依赖于大量肿瘤临床样本和机器学习算法。由于众多高通量数据库的建立，使得大...

Hayley笔记

细胞类型marker基因T CellsCD3D, CD3EThCD3D, CD3E, CD40LGTcCD3D, CD3E, CD8A, CD8BgdTTRDV2, TRGV...

黄晶_id

通过exprs函数获取表达矩阵后我们可以通过以下三种方法判断是否需要进行log2转换 1.肉眼识别 最简单粗暴的方法就是，根据数值大小粗略估计：如果表达量的数值在50以内，通...

Hayley笔记

1. Cre-loxp系统及其应用介绍 Cre-loxp系统源于P1噬菌体的高效重组系统。Cre (Causes recombination; Cyclization rec...

周运来就是我

前言 我们知道，细胞间信息传递方式一个是细胞表面配受体的相互作用，另一个通过细胞产生的可溶性小分子，即细胞因子。在单细胞数据分析中下游，有时候我们想看某几种细胞类型之间的相互...

Hayley笔记

轨迹分析系列： 单细胞之轨迹分析-1：RNA velocity[https://www.jianshu.com/p/ee0f7a8e6a06] 拟时间序列分析（Pseudot...