秋柔嫣姬

@八号地锅 另外一篇关于anvio的翻译教程有提到怎么提取单拷贝基因的。那边要是没有能解决你的问题话。我也没办法了，我很久没用有点忘了。

anvio泛基因组分析

具体的泛基因组分析流程说明anvi'o泛基因组分析流程[官方版本(翻译)] - 简书 (jianshu.com)[https://www.jianshu.com/p/b91b...

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新组装的基因组并没有上传和生成RefSeq基因组信息。而且一系列需要or.db或者构建or.db的步骤尝试构建数据库都不成功，要么缺乏物种信息，要么缺乏gene symbol...

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anvio直接跟着作者github的流程conda安装就好了。作者写的步骤非常清楚

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@科研花花 还有一种最简单粗暴的解决方法就是，如果你们使用的服务器是自己小组的话可以直接去服务器的那台电脑弄（插一下显示器和键鼠？），在那里装一下浏览器，让anvio直接拉起可视化界面。在控制服务器的电脑上弄完可视化的工作。建议带一个比较了解这个服务器的牛马一起弄

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@科研花花 前面说的电脑装的linux系统是指开机进的就是linux系统而不是基于虚拟机或者windows的子系统。我的电脑是双系统的，anvio是直接安装在linux中的。

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@科研花花 在window下安装anvio可能比较麻烦，因为这个软件就几十个G，但是一定要安装的话按照作者的教程直接使用bioconda安装我记得是没问题的。虽然会报错但是是可以运行的，一些报错忽视就好了。然后你这边Ubuntu安装有问题的话可以去找一下有关wsl2的安装教程，这个子系统安装的视频在B站都挺多教程的。然后那个wsl系统可视化的工具在这篇简书里面有链接，你看以点过去看一下。但是需要保证wsl2安装无误。

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startxfce4个人觉得是wsl系统下比较好用的可视化软件了，我记得是需要在里面安装一下浏览器的啥的。反正多捣鼓一下应该就行，有时太久不用这个我也会忘了怎么启动了。视频教程里我记得是挺详细的了

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@科研花花 如果是系统直接装的linux系统的话，直接安装火狐或者谷歌浏览器，软件自己就能拉起可视化界面了

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数据准备ASV_table和tax_table，即asv丰度表和asv的注释表其次需要安装Hmisc和igraph这两个包 输出结果：①network.node_list.t...