@赵会成 如果公司返回来的双端数据结果，没有给barcode序列，如何获取它的信息呢？
2018-04-17宏基因组实战qiime2-201802（三）去除引物和Barcode这一步我也是走了很多弯路啊，之前没有去掉引物和barcode，所以跑程序经常断掉。 我还在论坛发了一个帖子询问https://forum.qiime2.org/t/self-...
发简信
IP属地：福建
-
-
你好，对于一个fastq文件中，包含正反向序列，这种用什么软件拆分啊？
使用seqtk来分割混合的fastq序列
前几天从SRA数据库下载的.sra数据在解压的时候没有使用 fastq-dump--split-files DRR**来分割两个文件，而是直接生成了一个fastq文件 然而我...
-
解决我的大问题了，博主厉害
下载ENA数据库文件
ENA数据库：European Nucleotide Archive：隶属EBI (European Bioinformatics Institute)，由 EBI 负责维护...
-
下载ENA数据库文件ENA数据库：European Nucleotide Archive：隶属EBI (European Bioinformatics Institute)，由 EBI 负责维护...
-
@赵会成 请问你的情况，解决了吗？
2018-04-17宏基因组实战qiime2-201802（三）去除引物和Barcode
这一步我也是走了很多弯路啊，之前没有去掉引物和barcode，所以跑程序经常断掉。 我还在论坛发了一个帖子询问https://forum.qiime2.org/t/self-...
-
你好，网上下载sra数据，是双端测序，用Fastq-dump拆分成fastq，那么拆分过程中会去除掉barcode吗？
Fastq-dump: 一个神奇的软件
现在可以用fasterq-dump, 速度更快，请阅读都8102年了，还用fastq-dump，快换fasterq-dump吧 做生信的基本上都跟NCBI-SRA打过交道,尤...
-
你好，请教您一下，如果公司没有提供raw data的barcode，那么制作metadata.csv文件时，应该如果制作barcode那一列？
qiime2踩雷手记
前言 之前一直使用qiime1+usearch或者qiime1+vsearch，因为一直很诟病qiime2里封闭的系统。但最近还是因为某些需求需要里里外外的看一堆qiime2...
-
你好，网上下载的数据，如何找到它的barcode序列？
微生物多样性qiime2分析流程(2）使用qiime2和dada2处理16S序列
我不太确定这篇文档里还有没有打错的命令，代码建议参考：一文完不成qiime2微生物多样性分析(2021版上)[https://www.jianshu.com/p/725ee7...
-
-
你好，请问一下，我返回来的数据是公司将双端测序的结果进行拼接、指控后得到的，每个样本只有一条.fq文件，这种如何导入啊？
Qiime2-2.导入文件
我我我终于要回来写qiime2了。折腾其他东西了一段时间，终于有时间回过来写这个了！ 具体如何导入文件可以参考：Qiime Importing Data 由于大部分人获得的数...
-
Adonis与ANOSIM检验究竟是什么？做微生物16S测序的时候，公司的报告里经常会给到两种检验Adonis和ANOSIM，听过t.test、wilicox、anova各种检验，那么Adonis和ANOSIM检验是...
-
简书居然没有搜索功能简书居然没有搜索功能 我们知道博客文章之类的网站搜索功能是比较重要，简书居然没有了，首页居然找不到任何的搜索框，是隐藏起来了还是放到啥地方了，自己的文章没法检索就算了。首页既...
-
优美胜于丑陋，明了胜于晦涩，简洁胜于复杂。<br>复杂胜于凌乱，扁平胜于嵌套，间隔胜于紧凑。
-
差异分析工具STAMP手册2:使用手册（汉版）出于时代的自觉，我主动承担了STAMP(Statistical Analysis of Metagenomic Profiles)使用文档的翻译工作。原文28页，翻译如下，欢...
-
你好，用qiime2进行物种组成分析时，显示
There were some problems with the command: Missing option '--p-r-primer'.Missing option '--o-reads'. "--output-dir" may also be used)Got unexpected extra argument微生物组16S rRNA数据分析小结: qiime2-2019.1
本次笔记内容：qiime2-2019.1的16s分析流程，以没有barcode，以demultiplexed的fastq文件为input.同微生物组16S rRNA数据分析小...
