Module 0:试运行 VIRGO 本模块概述了如何测试 VIRGO 以确保其按预期工作。在目录 testrun 中包含测试数据集: 运行 step1 和 step2 脚本...
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测序上游分析系列: mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵:上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline:从raw r...
第一次尝试医学统计常用的MR,我选择了比较多用的R包,TwoSampleMR, 这个包还有一个webApp -- MRbase.所有流程基本和网上可以搜到的一样,这里推荐这个...
1.下载 2.读取暴露文件 2.1 使用TwoSampleMR获取MR base提供的数据 (要求网络状态良好,并且需要提前知道暴露的ID号,以体质指数为例,该暴露号为‘ie...
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因为样本数量比较可观,所以可以进行WGCNA分析。这里是并不需要选取所有的基因来做WGCNA分析,挑选的标准可以是top变异程度大的基因集合,或者显著差异表达的基因集合等等。...
本篇代码参考文章:1.生信菜鸟团:一文学会WGCNA分析2.WGCNA(加权基因共表达网络分析)3.WGCNA分析,简单全面的最新教程4.WGCNA实战练习5.STEP6:W...
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