@YY_8d52 可能是包更新了,现在没有cells这个参数了
使用scRepertoire包进行单细胞免疫组库数据分析简介 scRepertoire包是由华盛顿大学的Nick Borcherding博士开发,是一款针对10X V(D)J数据的免疫组库分析工具。它可以直接读取10X cellr...
@YY_8d52 可能是包更新了,现在没有cells这个参数了
使用scRepertoire包进行单细胞免疫组库数据分析简介 scRepertoire包是由华盛顿大学的Nick Borcherding博士开发,是一款针对10X V(D)J数据的免疫组库分析工具。它可以直接读取10X cellr...
@飞鸿_2257 不客气
scCustomize:自定义可视化你的单细胞数据(一)简介 scCustomize是一个单细胞转录组数据可视化的R包,里面集合了一些常用的数据可视化方法,可以与Seurat包进行很好的联用,支持Seurat,LIGER和SCE等...
生态、医学、药学领域大量高通量测序数据的产生,使得数据分析和解释的复杂性日益提高。然而,微生物组和病毒组领域仍然缺乏一个方便和无编程的桌面应用程序来全面分析微生物组和病毒组数...
概览 Title:From GWAS to Function: Using Functional Genomics to Identify the Mechanisms Un...
可以读取自己的maf格式文件进行可视化的
R语言可视化(二十八):瀑布图绘制28. 瀑布图绘制 清除当前环境中的变量 设置工作目录 使用waterfalls包绘制瀑布图 使用maftools包绘制瀑布图 使用GenVisR包绘制瀑布图
哈哈,赶紧用起来,顺便帮忙推广一下😄
OmicsSuite多组学大数据分析及可视化程序阶段总结OmicsSuite v1.3.9OmicsSuite: 定制的流程化多组学大数据分析及可视化的桌面端套件。Note:OmicsSuite前名为BioSciToolsGith...
@星点儿 你可以看一下这个,做个转置在做scale归一化https://www.jianshu.com/p/115d07af3029
如何轻松绘制基因表达聚类趋势图
OmicsSuite v1.3.9OmicsSuite: 定制的流程化多组学大数据分析及可视化的桌面端套件。Note:OmicsSuite前名为BioSciToolsGith...
1. TOmicsVis R包简介 TOmicsVis v1.2.2Title: Transcriptomics VisualizationWebsite:https://b...
@一芨芨草 是的,是表达量的FPKM值进行了row的z-score归一化处理
如何轻松绘制基因表达聚类趋势图
@小洁忘了怎么分身 这里应该是写错了的,应该是小于0.05的
NBIS系列单细胞转录组数据分析实战(一):数据质控Single cell RNA-seq analysis workshop 该系列课程由瑞典国家生物信息学基础设施(NBIS) 负责设置,为瑞典Phd学生,博士后,研究人员和...
一、 写在前面 2023年4月中旬自己开始做基因家族的分析,对于这块自己没有接触过,因此也是一个挑战,没事!!!(安慰自己),对于基因家族的分析网上的教程很多,跟着步骤走就可...
摘要 免疫细胞的分化、发育和激活需要转录程序的精确和协调控制。基因组的三维(3D)组织结构已成为染色质状态、转录活性和细胞身份决定的重要调节因子,它可以通过促进或阻碍转录调控...