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可移动原件--转座transposition---耐药毒力基因的转移转座是一类可以在基因组中移动位置的 DNA 片段，又被称为“跳跃基因”. 它们最早是 20 世纪 40 年代 Barbara McClintoc...
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副流感病毒（HPIV）基因测序分型：从探针捕获到基因型分析副流感病毒 HPIVs 基因组全长约为15.4~17.3 kb，不同血清型HPIVs基因组长度的差异主要来源于非编码区序列长度的差异。 HPIV...
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诺如病毒选择什么方法进行基因组测序？如何分型后期会在B站上更新视频！ 诺如病毒（Norovirus）属杯状病毒科（Caliciviridae），正链单股RNA，基因组长度约 7.5–7.7...
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基因测序系统进化树，有几个SNP 才可以判断同源？
Ai基因测序 尽管已有众多案例表明WGS在病原菌分型与溯源中的优势，但在实际应用中依旧面临着众多挑战。例如，目前尚缺乏国际通用的细菌基因组数据采...
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评价病原微生物耐药基因与药敏实验（耐药表型）之间的相关性--Kappa系数耐药基因我们常将耐药基因制作成一张热图，看某一种微生物是否含有此耐药基因。总会有一种想法，我们是否完全通过基因测序就能够预测该病原的耐药性呢？（...
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耐药基因的获得与热图构建最近刚好写了一篇关于耐药基因相关分析的常规文章，分享一下最近的经验，方便大家借鉴参考我使用的是card,conda 安装abricate工具，写...
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病原微生物基因测序后的物种鉴定每次基因测序下机后似乎工作就已经完成了，但是我这次测的对不对呢？我有没有把样本的顺序弄错了（我相信只要不是全自动的仪器，大家肯定都犯过错，因为有...
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NCBI 介绍以及参考基因组SRA数据下载大全NCBI中常用到的数据功能：1.下载参考基因组 2.下载相关测序数据，构建进化树 1.下载参考基因组 https://www.ncbi.nlm....
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NextClade --病毒分析分型利器大家肯定都听说过新冠病毒分型，像什么包括阿尔法、贝塔、德尔塔、奥密克戎变异株BA.2.12和BA.2.12.1。。。。这些分型是怎么来的？ 基因...