第一次找到如此清楚描述表型,初学小白感谢
3.1 GWAS:表型鉴定与记录的基本原则和原始数据处理精确的表型检测是关联分析的关键,GWAS对数量性状和质量性状都适用。 1.各类性状的特点及鉴定与考察建议 2.表型的基本处理 2.1 正态性检验 关联分析属于线性模型,要求...
第一次找到如此清楚描述表型,初学小白感谢
3.1 GWAS:表型鉴定与记录的基本原则和原始数据处理精确的表型检测是关联分析的关键,GWAS对数量性状和质量性状都适用。 1.各类性状的特点及鉴定与考察建议 2.表型的基本处理 2.1 正态性检验 关联分析属于线性模型,要求...
精确的表型检测是关联分析的关键,GWAS对数量性状和质量性状都适用。 1.各类性状的特点及鉴定与考察建议 2.表型的基本处理 2.1 正态性检验 关联分析属于线性模型,要求...
导读 barrnap预测细菌基因组16S,获取结果文件第二行最长16S,保留>1400bp的16S。mafft做序列对齐。trimal修剪序列。fasttree建树。ggtr...
@爱吃海椒的妹妹下面共有序列有小写字母,大写字母和数字,数字貌似是表示极性?
利用GeneDoc美化同源比对结果软件准备:GeneDoc下载地址http://www.jalview.org/getdown/release/[http://www.jalview.org/getdown/...
补充一下,关于最佳m值的探索可以通过optm这个包来确立。
本人运行admixture两个月,至今未找到问题根源可以解决,参考数据都不行,实在崩溃不已。。。太难了,难道走错行业了,望简书的家人们能帮我找到问题所在 (通过conda安装...
你好,比对后共有序列含有数字是啥含义呀?
利用GeneDoc美化同源比对结果软件准备:GeneDoc下载地址http://www.jalview.org/getdown/release/[http://www.jalview.org/getdown/...
之前有一次,我导说“能不能把这些基因按顺序画在果蝇的染色体上”,因此,我寻找了一些实现这个需求的方法。经过一番奇奇怪怪的操作之后,最终用ggplot2画了。。。其它方法简单地...
01-Definition Genetic Distance Genetic distance is the degree of genetic difference (ge...
博主,我运行admixture,没有结果文件.P和.Q,也不报错,不论是.ped还是.bed作为输入文件,都没结果,救救孩子吧
Linux 安装admixture1、安装VMware tools或挂载共享文件夹2、下载anacondahttps://repo.anaconda.com/archive/[https://repo.ana...
对于最适m值会有多次重复,那么绘制树图时最适m值的第几次重复可以当做最后结果呢?每一个重复的结构都不太一样
【群体遗传】Treemix四倍体分析 & 最优m值选择距离上一次写博客,已经是上一次了。 之前已经有生信菜鸟团前辈写过关于Treemix的分析,但值得关注的是,现在的软件大部分都只适用于二倍体,那今天介绍一下四倍体怎么进行Tre...
距离上一次写博客,已经是上一次了。 之前已经有生信菜鸟团前辈写过关于Treemix的分析,但值得关注的是,现在的软件大部分都只适用于二倍体,那今天介绍一下四倍体怎么进行Tre...
基因流(也称基因迁移)是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质,从而改变群体“基因库”的组成。通过基因交流向群体中引入新的等位基因,是遗传变异一个非常重要的来源,...
群体结构是指材料的亚群分化情况,会导致标记间的非连锁关联,进而导致关联分析结果出现假阳性。 地理隔离、人工选择、移民和遗传漂变等都可能导致群体分化。 是指遗传变异在物种或群体...