新版本更加稳定,颜值更高,推荐大家使用。 新版特性概要如下: 一、添加新功能 1. 提供基于核苷酸序列K-mer特征的层次聚类分析工具。 2. 在“Mutation Anal...
转眼又临近毕业季,离别是总会到来的,但也可以选择留下点什么,如题。 考虑到大家都非常忙,有的甚至还在熬夜写基金,为此我也长话短说。 对于做序列分析的同学来说,每年这个时候总是...
接头和测序引物结构示意图 这个图画错了吧,按照这种画法,P5、P7端反向互补?
NGS 数据过滤之 Trimmomatic 详细说明tags: Trimmomatic NGS fastq NGS 原始数据过滤对后续分析至关重要,去除一些无用的序列也可以提高后续分析的准确率和效率。Trimmomatic 是...
中午到老友家吃饭,晚上和朋友去西园吃饭,都聊了两三个小时。知道我的人可能多少有了解,我个人是非常享受边吃饭边聊天,尤其是慢慢聊,随便聊的时间。所以,今天原本我心情挺好。多少也...
一般用同一性,有的论文里标的是相似性,其实算的也是同一性。
使用BioAider快速生成核苷酸+氨基酸序列同一性矩阵在进行序列分析时,难免要做一张序列两两比较的同一性(大致和相似性差不多)表,比如下面这样的: 单一核苷酸或者氨基酸序列同一性表比较好办,可以通过Geneious (付费软件)...
@8fd8302f528a
没有比这更方便的了
使用BioAider快速生成核苷酸+氨基酸序列同一性矩阵在进行序列分析时,难免要做一张序列两两比较的同一性(大致和相似性差不多)表,比如下面这样的: 单一核苷酸或者氨基酸序列同一性表比较好办,可以通过Geneious (付费软件)...
标签:生信分析,系统发育,进化树 RaxML是最大似然法(ML法)建树的经典软件,可以建有根树,支持服务器上多线程运行。而且RaxML是目前为数不多支持ML法多基因联合建树的...
标签:生信分析,系统发育 背景:RDP是一款检测重组或重配的软件,适用于Windows 95/98/NT/XP/VISTA系统的软件(其实win7/8/10也可以),这款...
N久没有更新了,最近一段时间有点繁忙。今天,一起来学习一下一个和Circo图差不多的图:Edge Bunding图(不知道中文咋翻译)。其实在我看来都只是不同形式的网络图。 ...
很多时候,我们需要寻找或者筛选某条序列中存在的重复片段,同时我们事先也不知道有哪些重复片段,以及它们的长度。 相比与其他软件,我更喜欢BioAider里的这个简洁的寻找重复片...
无论是小尺度(少量)的序列集,还是大尺度(大量)的序列集,无论是基因片段的突变分析,还是全基因组的突变分析。 又或者,序列为非编码基因,或非编码基因+编码基因,或单纯的编码基...
曾经有一段时间我也是这么困惑的,直到后面,我想通了。
没有理想的人不伤心按照惯例每年生日都会写一篇文,但是今年6月的时候没有太多的想法,所以就搁置了,时隔2个月,终于有了起笔的想法。 看了看上一年的日志,我想在去年写日志之时,无论如何都不会想到今...