多重序列比对(Multiple-Sequence-Alignment , MSA)应该是序列分析中最为基础的操作了,笔者之前发了很大笔墨介绍了MAFFT这款软件的使用(MAF...
举个栗子🌰: 最近对拟南芥中的一个叫做CBF的基因非常感兴趣,现在我想看看这个CBF基因在一个新测序的物种Am基因组上是否存在,Am中有几个CBF基因?这样的查找可以通过本地...
怎么分析啊?
Bland-Altman Plots(一致性评价)在R中的实现假设有reader1 和reader2,分别对一定数量病人的某一影像指标进行评分,现在想看一下这两位研究者评分的一致性,绘制Bland-Altman图是一种较为直观、简单的方...
假设有reader1 和reader2,分别对一定数量病人的某一影像指标进行评分,现在想看一下这两位研究者评分的一致性,绘制Bland-Altman图是一种较为直观、简单的方...
数据及基础图形的绘制 1、数据——以R自带数据集iris为例 2、基于ggplot2包绘制散点图 局部放大效果的实现 1、加载包——主要基于ggforce包实现图形的局部放大...
1、中国抗疫早在一年前就已经胜利,现在的新冠完全就是另一种冠状病毒。只不过国家为了保护我们,政策坚持到现在。 2、现在的新冠病毒是从南非免疫力低下的人群中,通过定向进化筛选出...
“进化树的构建怎么操作?”“那肯定是用MEGA啊!” 可是真的好麻烦啊,要先比对再建树,然后再进行各种美化,习惯了R就用R解决吧。 简单Google之后发现R有现成的包可以完...
本文是对前几天的打脸打脸之处就在于发现了muscle的R包,从此不用再为序列比对东奔西跑—— Step 1. 从基因名拿到序列 这一步用到的包:biomaRt ,选择用sym...
前言 目前R 3.6.1 都已经preRelease了,我笔记本上的电脑也赶忙把R从3.5.4升级到3.6.0(当然生产力相关环境还没敢乱升级,毕竟升级一次R语言还是容易碰到...
A260nm是核酸最高吸收峰的吸收波长,最佳测量值的范围为0.1至1.0。如果不在此范围,稀释或浓缩样品,使之在此范围内;如果吸光度小于0.05,检查是否存 在操作因素(如移...
qRT-PCR实验原理 RT-qPCR由普通PCR技术发展而来,它是在传统PCR反应体系中加入荧光化学物质(荧光染料或者荧光探针),根据各自不同的发光机制实时检测PCR退火、...
企业培训计划制定五大要点 培训计划是按照一定的逻辑顺序排列的纪录,它从组织的战略出发。在全面、客观的培训需求分析基础上做出的对培训时间(when),培训地点(where),培...
(1)log信息共有四个等级,按重要性递增为:INFO(通知)<WARNING(警告)<ERROR(错误)<FATAL(致命的);(2)值的含义:不同值设置的是基础log信息...
语义解释:from_tensor_slices,从张量的切片读取数据。 工作原理:将输入的张量的第一个维度看做样本的个数,沿其第一个维度将tensor切片,得到的每个切片是一...
本书的第二章5个秘诀主要是与如何备考相关,如果有需要可以去看原著。 在这一章中作者提到了两点,是对上一章关于记忆和睡眠的补充。 1.“深入的看4小时不如一小时看一遍,看4遍”...