推断物种系统发育关系以及分歧时间对探讨物种起源与演化具有重要意义。通过最大似然法(ML)构建物种进化树以及估算物种分化时间在比较基因组学的研究进展中已经成为了必不可少的“套路...
1.JupiterPlot下载地址:https://github.com/JustinChu/JupiterPlot[https://github.com/JustinChu...
从远端服务器A(192.168.XX.XX)传到当前服务器B 举例 从A服务器(192.168.XX.XX) 的 /p300s/ayunga/Project-R的数据, 传到...
split 按照多少行切分,按照一行一个文件 后缀 指定拆分后生成顺序文件名为数字方式,从01开始计数 前缀,写在最后 举例
Build from Release Tarball 访问GitHub , release中寻找最新版本(https://github.com/vcftools/vcftoo...
seqkit 安装 使用 结果展示
Linux中的alias命令可以将一条复杂的命令缩短为一个简单的指令,实际工作中经常会用到。使用alias的时候命令本身需要使用单引号包括起来。但是如果命令本身中包含单引号怎...
大致的流程如下:BBtools --》 Trinity(v2.8.5) --》 Transdecoder --》Trinotate (3.2.1) 1. 合并左右read...
前言 ggplot2 中有两种绘制条形图的函数:geom_bar() 和 geom_col() geom_bar() 使条形的高度与每个组中的观察值的数目成正比,或者如果设置...
1.目的 使用 dotPlotly 可视化 minimap2 或者 mummer 得到的序列比对结果。 2.安装 dotPlotly 其实就是个R程序,运行依赖3个R包。这里...
把要提取的 序列 ID 写入 id.txt , 一行一个ID 1.seqkit 2.seqtk
1.bioawk 输出结果示例: 2.seqkit 输出结果示例: