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@南祁齐 然后再用随机森林 基尼系数来看基因对差异程度的贡献 这样筛选出来的也是marker
Seurat中FindMarker寻找两个cell type差异基因的若干方法
加载示例数据 1.运行Seurat 2.差异分析计算logFC值 其中：对象 cells cells包括两种cell type的细胞barcodes（即每一个单独的细胞）对象...
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@南祁齐 可以的 我感觉你是想知道统一细胞类型在不同处理的差异 可以先做一个这个https://www.jianshu.com/p/e838e337398a
Seurat中FindMarker寻找两个cell type差异基因的若干方法
加载示例数据 1.运行Seurat 2.差异分析计算logFC值 其中：对象 cells cells包括两种cell type的细胞barcodes（即每一个单独的细胞）对象...
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@南祁齐 建议不要单独拿出来 因为选特征细胞 find marker是通过整体表达矩阵为特征做的 单独拿出来就只有局部信息了
Seurat中FindMarker寻找两个cell type差异基因的若干方法
加载示例数据 1.运行Seurat 2.差异分析计算logFC值 其中：对象 cells cells包括两种cell type的细胞barcodes（即每一个单独的细胞）对象...
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@南祁齐 没有批次效应的情况下 整合两套数据 单独将同一个cell cluster但来源不同的细胞做差异
Seurat中FindMarker寻找两个cell type差异基因的若干方法
加载示例数据 1.运行Seurat 2.差异分析计算logFC值 其中：对象 cells cells包括两种cell type的细胞barcodes（即每一个单独的细胞）对象...
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@sparking 负相关
DCA：liquid correlation analysis
前言 这是香港中文大学(深圳)数据科学学院于天维教授的一篇文章《A new dynamic correlation algorithm reveals novel funct...
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@sparking 直系同源
从统计学的角度理解RNA-seq
这次是分享李婧翌团队的一篇综述《Modeling and analysis of RNA-seq data: a review from a statistical pers...
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@sparking 是的
DCA：liquid correlation analysis
前言 这是香港中文大学(深圳)数据科学学院于天维教授的一篇文章《A new dynamic correlation algorithm reveals novel funct...