您好,我想请教一下Blacklist,是啥文件在哪获得?
ATACseq 分析流程ATACseq 基本原理如下图所示。真核生物 DNA 与核小体结合形成染色质,结合的紧密程度是动态变化的。当 DNA 需要复制或转录时,结合变得松散让 DNA 暴露。暴露的 ...
您好,我想请教一下Blacklist,是啥文件在哪获得?
ATACseq 分析流程ATACseq 基本原理如下图所示。真核生物 DNA 与核小体结合形成染色质,结合的紧密程度是动态变化的。当 DNA 需要复制或转录时,结合变得松散让 DNA 暴露。暴露的 ...
以前做生物信息都需要去各种各样的生物软件官网进行软件下载,不过现在有一个conda就够了。它就像是我们windows系统里的360软件中心,大部分软件都可以通过它来进行下载和...
您好,看了您的文章,在实操时R语言报错
Error in function (type, msg, asError = TRUE) :
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请问这是由于什么原因造成的呢?
exp.csv是RNAseq数据还是突变数据?
TCGA突变数据下载与处理实验内容 1.在TCGA数据库下载疾病BRCA的突变数据熟悉TCGA数据库的结构与数据下载方法2.处理下载数据,将其变为列为样本行为基因的形式并输出(数据处理过程中去掉同义突...
实验内容 1.在TCGA数据库下载疾病BRCA的突变数据熟悉TCGA数据库的结构与数据下载方法2.处理下载数据,将其变为列为样本行为基因的形式并输出(数据处理过程中去掉同义突...
Cox比例风险模型(考克斯,1972年)是常用的统计在医学研究调查的患者和一个或多个预测变量的存活时间之间的关联回归模型。基础知识可见:R-回归分析[https://mp.w...
1.KM-plot 2.logrank批量生存分析 3.cox批量生存分析 *生信技能树课程笔记
一.基本概念 "一张统计图形就是从数据到几何对象(geometric object, 缩写为geom, 包括点、线、条形等)的图形属性(aesthetic attribute...
1-1从GEO数据库下载数据 1-2提取表达矩阵exp 1-3提取各样本的分组信息 1-4调整exp的行名顺序与pd列名完全一致 1-5提取芯片平台编号,保存 2-1提取分组...
数据库背景介绍 TCGA,全称:The cancer genome altas官网:https://cancergenome.nih.gov/[https://cancerg...
@苏牧传媒 联系了包的作者张子杰老师,只能在linux上安装,windows不行
m6A-seq_analysis_workflowgithub:https://github.com/scottzijiezhang/m6A-seq_analysis_workflow 网页:https://scottzij...
问题描述:遇到一位同学他的SEQ数据是13年的,illumina双端测序,而且是无参物种,分别是病毒和昆虫拼接好的转录组序列。而且还不是同一批样本。然而我比较熟悉RNAseq...
TCGA|GEO可视化分析第2篇---KEGG|GO分析大全 沉迷工作的我[https://www.jianshu.com/u/82c2c57a3f59] 导读:之前讲了如何...
转载:留着自己以后看workflowr简介 我们知道在win或者Linux上将自己的脚本上传到GitHub上我们可以通过Git插件轻松完成,那么在R上我们也可以做到将R脚本或...