今天分享的学习笔记是一套转录组分析简单流程，适用于初学者入门阅读，从原始测序数据开始，经过质控、序列比对、定量表达、差异表达、功能富集等一系列分...
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RNA-seq转录组数据分析丨一套完整的案例流程
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RNA-seq 详细教程：分析准备（3）
学习目标 了解 RNA-seq 和差异表达基因的分析流程 了解如何设计实验 了解如何使用 R 语言进行数据分析 1. 简介 在过去的十年中，RN...
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RNA-seq 详细教程：count 数据探索（4）
学习目标 了解 RNA-seq count 数据的特征 比较 count 数据的不同数学模型 确定最适合 RNA-seq count 数据的模型...
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RNA-seq的counts值，RPM, RPKM, FPKM, TPM 的异同
RNA-seq的counts值，RPM, RPKM, FPKM, TPM 的异同 现在常用的基因定量方法包括：RPM, RPKM, FPKM, ...
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外泌体多组学10-尿液细胞外囊泡miRNA有效数据
文章目的：前列腺癌细胞可以释放细胞外囊泡到胞外环境中并且可以在尿液中被检测到，文章对9个前列腺癌病人与4个正常男性的尿液细胞外囊泡miRNA表达...
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差异基因通路富集分析的统计学假设和关于p值的理解单细胞转录谱可以根据基因表达水平进行差异分析，通过差异分析，我们可以知道不同分群之间是否存在差异，以及存在显著表达量差异的基因集(DEG,在单细...
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WGCNA得到模块之后如何筛选模块里面的hub基因
WGCNA得到模块之后如何筛选模块里面的hub基因 原创 生信技能树 我在生信技能树多次写教程分享WGCNA的实战细节，见： 一文看懂WGCNA...
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RNA-seq名词解释（4）
(五)比对相关 blast：Basic Local Alignment Search Tool，一种序列比对的工具。 mapping：reads...
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RNA-seq名词解释（8）（十）、分析流程及软件列表 有参转录组：针对有参考基因组序列的物种进行 mRNA 的分析。 无参转录组：针对尚无参考基因组序列发布的物种进行 m...
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iTAK：在线预测全基因组转录因子TF，转录调节因子TR与蛋白激酶PK前言 康奈尔大学，FeiLab的一个预测工具。 iTAK 是依赖于数据库的用于从蛋白质或核苷酸序列中识别植物转录因子 (TF)、转录调节因子 (...
专题公告
转录组分析
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