BSA分析 - 专题

1 原理详细信息参见2013年的QTL-seq 文献，这里只做简单介绍。 1.1 群体构建 QTL-seq 将 BSA（bulked-segr...

1.1 静绚 1 30

许多重要的农艺性状为数量性状，由多个基因位点控制。利用传统的分子标记技术进行基因定位，常常需要花费较长的时间和大量的人力物力。2012年日本岩手...

0.4 小红楼上的树影 3 8

刘小泽写于18.7.18表型与基因型相关联（基因定位）是遗传学上的重要问题。什么是重测序Resequencing？我们使用的基因组是怎么来的...

2.2 刘小泽 5 47

BSA（Bulked Segregant Analysis），集群分离分析或分离群体分组分析法。两个特点：1. 混池2. 性状分离所以，BSA可...

2.8 杨亮_SAAS 1 41

QTLseqr是一个用于BSA-seq的R包，它能够读取GATK输出结果进行过滤，最终使用SNP-index和G 统计值的方法进行定位。我们这次...

2.4 xuzhougeng 8 28

BSA虽然不是我最早接触的高通量数据分析项目（最早的是RNA-seq），但是却是我最早独立开展的数据分析项目，我曾经专门写过一篇文章介绍如何使...

2.4 xuzhougeng 2 28

接着上一篇留下的问题，如何按照以1M为窗口，每次移动10Kb计算均值。我们以KY131是"0/0", 而 "DN422" 是 "1/1"的位点...

2.4 xuzhougeng 0 16

下游分析下游分析可能是比较成熟化的流程分析，对服务器的要求比较高一些，下游分析则是对背景知识要求高一些，例如VCF的格式，遗传学的三大定律等。...

1.3 xuzhougeng 5 17