最近微信群有小伙伴抛出这样一张图，是一个细胞通讯LR气泡图，确切的说应该是Cellchat结果的可视化。我一看这不就是用Cellchat做的嘛。...
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复现SCI图表：Cellchat多组结果受配体结果气泡图可视化 -
scRNA-Seq | pySCENIC组织内细胞异质性的基础是细胞转录状态的差异，转录状态的特异性又是由转录因子主导的基因调控网络（GRNs）决定并维持稳定的。因此分析单细胞的GRN...
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单细胞转录组GSVA分析更新及可视化很久以前，我们在写单细胞分析的时候，就写过GSVA分析了，GSVA分析的全名叫Gene Set Variation Analysis，能够分析基...
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pySCENIC单细胞转录因子分析更新：数据库、软件更新****pySCENIC全部往期精彩系列：1、[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg5OTYzMzY5Ng==...
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Seurat::DoHeatmap 的谜之报错Seurat::DoHeatmap 的谜之报错 最近在学习Seurat教程（Seurat版本3.0.2），发现运行到倒数第二步做热图展示mark...
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定量免疫浸润在单细胞研究中的应用最近听说定量免疫浸润很火，于是我也报名参加了果子老师的课程，跑了几个R包，你比如说xCell啊，GSVA啊，MCPcounter啊，Consen...
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基因表达趋势分析-1：TCseqTCseq包可以应用于转录组，单细胞转录组，ATAC-seq，Chip-seq等的表观基因组时序型数据分析。该包主要用于不同时间点的差异分析，时...
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loom文件的生成
在单细胞测序的轨迹推断[https://www.jianshu.com/p/83c532234dc0]中，我们介绍了RNA速率分析的原理，进行速...
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单细胞分析之细胞注释-1：AzimuthAzimuth：使用锚点整合的方法对单细胞类型进行预测，可以用于手动细胞注释结果的参考参考网站：https://satijalab.org/se...
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Seurat绘图函数总结（更新版）更多重要函数见：Seurat重要命令汇总[https://www.jianshu.com/p/104f9290af8b] Seurat绘图函数总...
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