背景介绍 verkko是一个最新的可以应用于二倍体基因组T2T（telomere-to-telomere）级别的基因组组装的组装软件。 2022...
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用verkko组装基因组
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生信步骤|kmc+genomescope进行基因组调查在组装未知基因组时，往往需要利用重测序数据提前进行基因组调查，以获取其基因组规模，杂合率，重复序列比例，GC含量等信息。从而更好地拟定后继测序策...
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BUSCO多样本作图BUSCO的原理及安装使用可参考：BUSCO - 组装质量评估 - 简书 (jianshu.com)[https://www.jianshu.c...
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十一. 叶绿体基因组 SNP Calling （bwa, samtools, picard, bcftools, plink）前言 最近分析叶绿体基因组，进行SNP Calling，网上搜到生信药丸[https://www.jianshu.com/u/068665394...
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【动植物研究动态】2022年1-3月收藏的文献
微信收藏夹中的文献解读，只整理出今年2022年已收藏的部分文献，之前的太多，不列了。后续计划每周更一次，自己会看得更认真点，解读更详细些。 Na...
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人类参考基因组一、人类参考基因组的来源 1、人类基因组计划 1）2001年草图，绘制人类基因组图谱 2、数据库的名称 1）UCSC：hg19，hg38 2）N...
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【动植物研究动态】20220313文献摘选
Hortic Res | 中国医科院药植所卢善发：药用植物北马兜铃染色体水平的基因组图谱[https://mp.weixin.qq.com/s/...
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富集分析结果雷达图单细胞绘图系列： Seurat绘图函数总结[https://www.jianshu.com/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2优...
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基因注释：基于SNAP+Augustus+GeneMark的maker3 pipeline
我使用的maker版本为3.01.04 第一轮：将已知基因比对到基因组 包括两个部分：🔸屏蔽重复序列🔸将已知的转录组/蛋白序列与基因组进行比对 ...
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