一、ScaleData()简介 单细胞基因表达counts矩阵数据经过NormalizeData()归一化处理后,还需要进行scale标准化。S...
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一、ScaleData()简介 单细胞基因表达counts矩阵数据经过NormalizeData()归一化处理后,还需要进行scale标准化。S...
1. Seurat对象查看当前的Assay 在进行了SCTransform操作后,矩阵默认会变成SCT矩阵,如果不加设置,后续的PCA等操作都是...
适用背景 在单细胞分析中,必要的一步是对每个细胞进行注释,这相当于给每个细胞打个标签,或者说起个别名,这些信息都存在@meta.data信息里,...
hello,周四了,这是第399篇文章,不知不觉中,已经写了很多了,但是前进的脚步是不能停止的,感觉自己要进入下一个阶段了,因为不能仅仅局限于分...
在数据分析过程中,常常需要把组间的显著性添加到图形中,但是在ggplot2中实现起来略显麻烦,幸运的是,有很多R包可以帮助我们实现这一操作,比如...
hello,大家好,这一篇我们来看一下张泽民新发表的文章,Temporal single-cell tracing reveals clonal...
今天领导非让写微信稿,其实我是不太想写的,但是呢,官大一级压死人,所以写的微信稿原版分享给大家,原版是不会有广告什么的,纯粹就是给大家分享一些好...
要实现单细胞mRNA测序,需要解决2个难题:1. 一个人类细胞中,RNA总量大约只有10pg左右(1pg=10-12g),其中mRNA的量大约只...
靶向基因表达技术主要针对在测序前直接从单细胞RNA-seq库中富集的相关靶向基因。通过杂交捕获特异性富集感兴趣的靶向分子,使靶向基因表达能够在显...
上一期,跟大家简单介绍了下单细胞ATAC的背景知识点及其10x ATAC基础数据的获取方式[http://mp.weixin.qq.com/s?...
专题公告
scRNA-seq, ST, scATAC-seq