数据类型
- 向量（vector）👈重要
- 矩阵（Matrix）
- 数组（Array）
- 数据框（Data frame）👈重要
- 列表（List）
一、向量
1.向量的概述
- 元素：数字或者字符串（用chr表示）
- 标量：一个元素组成的变量
- 向量：多个元素组成的变量
一个向量是一排有序排列的元素，以后会用到把一个向量作为数据框中的一列的情况
常用的向量写法：函数c ，将x定义为由元素1，2，3组成的向量
x<- c(1,2,3)
a:b , 从1-10之间所有的整数
x<- 1:10
范围和步长 from= ，to= ，by= , 1-10之间每隔0.5取一个数（注意是逗号不是分号）
x<- seq(1,10,by = 0.5)
a:b , times= , 1-3 重复2次
x<- rep(1:3,times=2)
2. 从向量中提取元素
2.1 根据元素位置 "[ ]"下标
- x[4] , x第4个元素
> x<- rep(1:3,times=2)
> x
[1] 1 2 3 1 2 3
> x[4]
[1] 1
- x[-4] , 除了第4个元素之外剩余的元素
- x[2:4] , 第2到4个元素
- x[-(2:4)] , 除了第2-4个元素
- x[c(1,5)] , 第1个和第5个元素
2.2 根据值
- x[x==10] , 等于10的元素
- x[x<0]
- x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素
> x<- rep(1:3,times=2)
> x
[1] 1 2 3 1 2 3
> x[x %in% c(1,2,5)]素
[1] 1 2 1 2
二、 数据框
> X<-read.csv('doudou.txt')
> X
X1 X2
1 A 1
2 B NA
3 C NA
4 D 3
5 E NA
3.1 读取本地数据
- read.table()
读取一个表格格式的文件，并从中创建一个数据框架。 - header
指示文件是否包含变量名称作为其第一行的逻辑值。如果缺少，则根据文件格式确定该值：当且仅当第一行包含的字段少于列数时，header设置为TRUE。 - sep
字段分隔符。文件中每一行的值都由这个字符分开。如果sep = "" （read.table的默认值），分隔符是 "空白"，即一个或多个空格、制表符、换行符或回车符。
> read.table("huahua.txt",sep = "\t",header = T)
X1 X2
1 A 1
2 B NA
3 C NA
4 D 3
5 E NA
> a <- read.table("huahua.txt",sep = "\t",header = T)
> a
X1 X2
1 A 1
2 B NA
3 C NA
4 D 3
5 E NA
3.2 设置行名和列名
X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
> colnames(X) #查看列名
[1] "X1" "X2"
> rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...
[1] "1" "2" "3" "4" "5"
> colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改
> X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名
> X
X2
A 1
B NA
C NA
D 3
E NA
3.3 数据框的导出
- write.table()
- quote
逻辑值(真或假)或数字向量。如果为TRUE，任何字符或因子列都将被双引号括起来。如果是一个数字向量，它的元素被作为引用列的索引。在这两种情况下，如果书写了行和列的名称，就要加上引号。如果为FALSE，则不引用任何内容。
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号）
3.4 变量的保存与重新加载
- save.image
#这次没有处理完的数据下次想接着用怎么办?--学会保存和重新加载。保存的格式是RData。
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令
3.5 提取元素
- X[x,y]#第x行第y列
- X[x,]#第x行
- X[,y]#第y列
- X[y] #也是第y列
- X[a:b]#第a列到第b列
- X[c(a,b)]#第a列和第b列
- X$列名#也可以提取列（优秀写法，而且这个命令还优秀到不用写括号的地步，并且支持Tab自动补全哦，不过只能提取一列）
3.6 直接使用数据框中的变量
plot(iris$Sepal.Length,iris$Sepal.Width)
三、Save R Objects
- save函数将R对象的外部表示法写到指定的文件中，之后，可以通过load或attach（或data）从文件中读取这些对象。
- save.image()
Usage
save(..., list = character(),
file = stop("'file' must be specified"),
ascii = FALSE, version = NULL, envir = parent.frame(),
compress = isTRUE(!ascii), compression_level,
eval.promises = TRUE, precheck = TRUE)
save.image(file = ".RData", version = NULL, ascii = FALSE,
compress = !ascii, safe = TRUE)
Arguments：
list:一个包含要保存的对象名称的字符向量。
file:连接或保存数据的文件的名称。必须是保存的文件名。
ascii: ASCII码，默认FALSE。
envir: 寻找要保存的对象的环境。
compress:逻辑或字符串指定是否保存到指定文件是使用压缩。TRUE对应于gzip压缩，而字符串“gzip”、“bzip2”或“xz”指定压缩的类型。当文件是连接和工作空间格式版本时忽略
save.image()
save.image()只是“保存我当前工作空间”的捷径。
> save.image(file = "test.RData") #保存当前所有变量
> save(mouse, file = "test.RData") #保存其中一个变量
> load(mouse.RData) #使用时加载命令
