linux环境下的软件安装

将miniconda下载到服务器上

• miniconda 清华
• 查看服务器多少位 uname -a
• 安装最新版本
• 复制下载链接 链接
• 登录服务器，进入biosoft
  cd biosoft
  wget 链接

怎么安装miniconda

• bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
• 激活
  source ~/.bashrc
• 输入conda 出现满屏信息说明成功
• 添加镜像

使用中科大的镜像

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes

使用conda

1. 查看服务器上安装的所有软件列表 conda list
2. 安装软件 conda install fastqc -y
3. 确认fastqc软件是否安装成功 fastqc --help
4. 卸载软件 conda remove fastqc -y