IGV的linux使用简介

使用

下载好IGV后，进入要查看的样本数据目录，直接：sh /path/IGV_Linux_2.17.1/igv.sh，将会自动开启界面（应该需要开启x11工具）。

重点记录一下常用的文件类型：

官网：Data Tracks - IGV Desktop Application

1、bam文件，会自动计算覆盖度曲线；

2、bed文件，文件后缀名若为bed，会放在refgene下面，否则会列在最上面；右键可以设置是否合并区域；

3、wig文件，可以用来查看GC分布。

文件格式如下：

最后编辑于：2024.05.15 10:39:43

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