电影《后来的我们》采用的是现在和过去两个时空来回穿插的叙事手法。见清和小晓的邂逅，是在2007年隆冬回家过年的列车上。小晓刚上车就找不到了自己的车票，遭到列车员的诘难，素不相识的见清拿出一张车票来问小晓是不是她掉的。小晓很快和见清他们三个同学混熟，在车停半道时相携下车踏雪回家。
小晓的妈妈再婚到了美国，爸爸已经离开人世。本不需要回家过年的小晓，还是回来了，她说她只想回来看看爸爸。见清的爸爸独自打理着林家菜馆，父子关系有些不愉快。小晓的意外出现，让见清和爸爸之间多出了一层润滑剂。
再回到北京的小晓和见清，已然成了毫无芥蒂的好哥们。小晓把她刚认识的博士男朋友带过来，见清问她喜欢这个人什么，小晓说他博士毕业、有房、工作单位好，还喜欢她，这就够了。见清无言以对，他喜欢小晓却说不出口，小晓说她男朋友的那些他一样也没有，但他很坚定地告诉小晓要找一个愿意为了她“上九天揽月，下五洋捉鳖”的男人。
见清和他的两个同学毕业后在电脑城开店，他会把送上门的生意推给小晓。岂知这一推，又给小晓推送了一个新男朋友。前面那个博士男朋友的妈妈来北京，不同意他们在一起，把小晓的房子梦打碎了，现在来的这个又是个公务员。小晓满心欢喜地向见清报告她的新恋情，见清却是一脸苦相。
跨年夜，小晓来见清租的隔断房找他。见清奇怪小晓怎么不和男朋友去跨年，小晓说男朋友工作忙。就在他们两个出门去跨年时，他们在商场见到了那位公务员男朋友扶着一位孕妇同行，原来他是有老婆的。
小晓就此在见清家住下。见清租住的隔断房生态古怪，有风尘气十足、得空便来撩拨见清的性感女郎，有墙上贴满AV女郎海报、成天宅在电脑前看片的结巴男，还有每天夜里啪啪啪的小夫妇。小晓和见清的同居生活，从小晓睡床、见清打地铺开始。
刚开始，见清还不习惯，起夜回来会自觉地躺到床上，等小晓翻个身把腿架到了他的身上，才意识过来，然后悄悄地滚回地上去睡。
隔壁小夫妇的声音太吵了，见清会拿耳机让小晓听音乐。小晓反倒借机僚拨见清，见清却只是装睡、并不接招。直到有一天，小晓看到了一个别人丢弃的旧沙发，缠着见清非要搬回来。就在旧沙发上，小晓和见清终于越过了朋友的界限。
此夜过后的第二天，见清一直等不到小晓回来。等到小晓回来时，告诉见清她又恋爱了。随后，见清因卖盗版盘被抓走。小晓独自回老家过年，瞒着见清的爸爸说他在北京工作忙。小晓年后去接见清出狱，见清问她又认识了一个什么样的男朋友，突然醒悟过来自己就是小晓口中的新男友。
从此之后的小晓和见清，虽然蜗居在隔断房里，却实实在在地度过了一段甜蜜的岁月。直到回老家参加同学聚会，见清租了车回来，还买了很多礼物送同学，却在卫生间门口意外听到同学们早已看破他的伪装。见清却把火撒在爸爸身上，年都不过就要回北京，路上他和小晓第一次吵架。从那以后，吵架就成为了他们蜗居生活中的常态。
见清的脾气越来越坏，他做游戏客服却大骂打电话进来的玩家，在路边摊有人和他斗两句嘴也会激怒他，转身就把那个人跩飞，回到家除了玩游戏，就是和女网友聊天，还被小晓给发现了。小晓再也没有办法忍受，决心离他而去。见清追到地铁站，看到已经上了地铁的小晓，他却没有勇气拽小晓下车。
失去小晓的见清，似乎成熟了一些，埋头制作的游戏居然很快就成功了。成功之后的见清做的第一件事就是去看房子，可他再和小晓相见，仍然是一副不成熟的样子。仍然不耐烦向爸爸讲解怎么用电视遥控器，仍然在爸爸不愿意去住他北京的房子时和爸爸吵架，仍然一副我现在有房子了我终于可以满足你了的态度和小晓说话。
见清仍然没有成熟起来，他不知道对于小晓而言，房子是需要的，但更需要的是他自己能够知道自己想要什么，然后可以陪他一起去努力，即便一直没有房子也不要紧。见清最想要的是小晓，最想要满足的是小晓的愿望，但彼时的他们不能够互相理解，不懂得好好沟通，终于错失了彼此。
直到2017年的再次邂逅，见清已经结婚生子，而小晓仍是孑然一人。两人因为航班延误而被困酒店。见清的儿子打来视频电话，吵吵着要看左边、看右边，然后小晓为了避开镜头而左躲右闪，两个人再一次在逼仄的空间里微妙地相处。小晓一句“后来的我们什么都有了，却没有了我们。”话中几多感慨，听者谁不泪下。
两人相拥作别，见清祝福小晓能够找到那个愿意为了她“上九天揽月，下五洋捉鳖”的男人。不知道此时的小晓心中作何感想，一部两个小时的电影都放完了，十年的大好青春都过去了，你还不知道老娘心里想要的不是什么“上九天揽月，下五洋捉鳖”，而只是好好在一起，不要轻易说放弃，失意时不必要自暴自弃，成功后也不要自以为是。
本片有着丰富的细节，让观众时刻沉浸在浅浅的怀旧气氛里，十年之前的我们身在何地？十年之后的彼此可还有所追忆？不论是对细节的把握，还是对结构的控制，甚至对节奏的拿捏，影片完全不像是一个新人导演的创作。如果非要说遗憾，那只能说本片贡献了又一个不成熟的男主角，这样的形象在青春片，尤其是华语青春片中太常见了，没有打破青春片的常规，没有突破一般观众的期待。
相比较而言，女主角就很出彩，起初她知道自己想要找一个条件好的男人，就会奔着目标去努力，即便一再碰壁也不自怨自艾，而当她发现自己想要的可以是爱自己却条件并不优越的男人，她仍然可以快乐地投入到这一段感情生活里，直到她发现对方并不懂她，也不懂他自己到底想要的是什么，于是果断放弃，一点儿也不拖泥带水。
