R语言数据结构
本教程整理自生信星球
向量
1.标量和向量的区分
元素指的是数字或者字符串（用chr表示）等
- 标量：一个元素组成的变量
- 向量：多个元素组成的变量
-
一个向量是一排有序排列的元素，可作为数据框中的一列
图源生信星球
x<- c(1,2,3) # 常用的向量写法，意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量。
x<- 1:10 # 从1-10之间所有的整数
x<- seq(1,10,by = 0.5) # 1-10之间每隔0.5取一个数（注意是逗号不是分号）
x<- rep(1:3,times=2) # 1-3 重复2次
2.从向量中提取元素
（1）根据元素位置
x[4] # x第4个元素
x[-4] # 排除法，除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4] # 第2到4个元素
x[-(2:4)] # 除了第2-4个元素
x[c(1,5)] # 第1个和第5个元素
（2）根据值
x[x==10] #等于10的元素
x[x<0] #小于0的元素
x[x %in% c(1,2,5)] #存在于向量c（1，2，5）中的元素
数据框
（1）读取本地数据
read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t", header = T)
a<-read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t", header = T)
（2）设置行名和列名
X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet" #有的公司返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#row.names为修改第一列为行名
（3）数据框的导出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F) #分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带双引号）
（4）变量保存与重新加载
#保存未处理完的数据，便于下次加载使用
save.image(file="bioinfoplanet.RData") #保存当前所有变量
save(X,file="test.RData") #保存其中一个变量
load("test.RData") #再次使用RData时的加载命令
（5）提取元素
X[x,y] #第x行第y列
X[x,] #第x行
X[,y] #第y列
X[y] #也是第y列
X[a:b] #第a列到第b列
X[c(a,b)] #第a列和第b列
X$列名 #也可以提取列（优秀写法，不用写括号，且支持Tab自动补全，但只能提取一列）
（6）直接调用数据框中的变量
options(stringsAsFactors = T)
a <-data.frame(case=paste0("S",1:9),values=runif(9)) #paste0()不带空格粘贴，runif()生成随机数
plot(a$case,a$values)
避免反复出现数据框名字的方法：
# 方法1：attach
# 将数据框名添加到搜索环境中：attach(a)，作图时只需输入列名(不需要$)
# 局限性在于两个以上数据框的列名有冲突时，同时attach会报错
attach(a)
plot(case,values)
detach(a) #事后记得detach
# 方法2：with
with(a,{
plot(case,values)
x<<-summary(values) #求和并赋值给x,<<的意思是作为全局变量，也就是出了大括号仍有效
})
x #运行完后打印x
作业：save(X,file="test.RData")，代码如果报错object X not found，是为什么，应该怎么解决？
答：由于R中区分大小写，本例中变量为x而非X，故应使用save(x,file="test.RData")
