生信星球103期作业
Linux环境下软件安装
新手必备的软件下载安装小助手——conda
- 虽然现在网上很多人会说有比conda更好用的docker啥的，但那都是大佬们用的，新人果然还是conda最香。
- conda的下载安装与镜像配置
- 这里用的是轻量级版的conda——miniconda
- 搜索“miniconda 清华”，或直接进入链接
需要在多个版本中找到适合自己linux安装的版本
要求：符合自己linux系统配置、最新
选择
- 然后右键复制链接
- 进入linux中
cd biosoft
wget 链接
- 下载好后
bash 文件名
- 镜像配置
conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
- 软件的安装与卸载
- 首先在conda里查找
conda search fastqc
查找
- 如果出现总报错的情况可以回到~目录下，
vi ./.condarc
然后在文件夹中删除defult那行
安装
conda install fastqc -y
安装
- 删除
conda remove fastqc -y
移除
