pyscenic做为scenic的python版本,相比R版本实现了分析速度上的巨大提升,尤其是最耗时的共表达网络构建步骤。实测时间如下,数据集1 (4257 cell x ...
pyscenic做为scenic的python版本,相比R版本实现了分析速度上的巨大提升,尤其是最耗时的共表达网络构建步骤。实测时间如下,数据集1 (4257 cell x ...
RSS特异性指数 继前一篇帖子[网络CSI评估基因关联性及regulon聚类模块化[https://mp.weixin.qq.com/s/p5c0ZcjmqCfLEUNP...
文章来源:公众号 科研论文时间这里分享几点配图的作图小技巧,让你也能轻松拥有漂亮的配图! 一、图片配色 其实决定图好不好看的第一要素就是****整体的配色。 配色的原则是要「...
我们知道在单细胞转录组数据分析的下游,在我们走过了fig1(通常是个图谱)之后,往往要沿着基因这条路深挖一下生物学意义。从bulk转录组数据中提取功能和机制的洞察力的功能分析...
相比于利用统计推断来做出合理的结论,做统计的人经常需要回答更上游的问题,例如“对于我预期的差异和置信水平,我最少需要收集多少样本?”,或者“在有限的样本和显著性水平的限制下,...
通俗统计之——如何计算统计功效(部分内容受教于网络,经个人理解阐述于此,不限版权,尽管转载) 1. 何为‘统计功效’? 统计功效,是用来描述,在你的实验研究中,你的统计检验正...
前言 很多人问我有没有关于全基因组关联分析(GWAS)原理的书籍或者文章推荐。 其实我个人觉得,做这个分析,先从跑流程开始,再去看原理。 为什么这么说呢,因为对于初学者来说,...
写在前面的话:GSEA对于生物信息学技能的要求不高,以至于不需要太多的生信知识就能学会,这也成为了生物研究生的必备技能,如果你还不会的话,这篇教程将让你100%学会,只要你从...
1. 数据下载 在读Single-Cell Reconstruction of Progression Trajectory Reveals Intervention Pri...