发简信
IP属地：宁夏
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DNA loop是什么——Loop结构学习摸索了很久，在中文网没有找到很理想的带领小白入门三维基因组学的专题内容，因此在学习的过程中想把这写内容记录下来，希望对后来的像我这样的学生能够得到一些帮助。 随着Hi-C...
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ChIP-Seq数据挖掘系列-3: Motif 分析(3) - 利用ChIP-Seq结果在基因组区域中寻找富集的Motifs# findMotifsGenome.pl: 在基因组区域中寻找富集Motifs HOMER 最初设计的目的用于ChIP-Seq peaks 中寻找富集motifs 。 #命...
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deeptools computeMatrix大坑
使用deeptools computeMatrix分析ChIP-seq数据，前期数据整理时，使用R整理和导出bed文件；反复运行报错； 折腾大半天，终于发现原因，写出bed文...
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求问：Chip-seq的motif分析
请问有人知道peak calling工具MACS里面的motif occurrence rate的图是怎么画的吗？ 最近看了MACS这篇论文，但是这个图不知道怎么实现，我使用...
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一个基因组学研究生
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heatmap.2作热图
library(gplots) setwd(‘/home/sun/SX/20180413_rnaseq/06_heatmap’) getwd() data <- read.t...
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生物信息学专业<br>公众号：生信学习手册
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生信小白，在这里记录一些笔记
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基础知识--增强子基础知识--增强子 一、定义 增强子(Enhancer) 又可译为强化子，是DNA上一小段可与蛋白质结合的区域，与蛋白质结合之后，基因的转录作用将会加强。增强子可能位于基因上...
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day30 ChIP-seq UCSC可视化参考教程：https://blog.51cto.com/u_15127592/2674467[https://blog.51cto.com/u_15127592/267446...
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