单细胞系列已经说了很多关于基因可视化的方法了。 单细胞基因可视化之小提琴图[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg5OTYzMzY5Ng==&...
之前一个图的做法,是一篇《cell reports》上的文章,展示marker基因的表达的时候,添加上了等高线密度图,(参考:单细胞marker基因可视化的补充---密度图与...
你好,不是说limma 去批次得出的数据不可以做差异分析吗,好像在哪里看到的
GSE83521/GSE89143去除批次效应老大在群里出的题,说感觉这个热图很诡异,然后中间我自己没有用boxplot查看数据的表达量,对于数据不能有正确的认识,导致一开始的deg的logFC都没有达到正负1的,最重要...
老大在群里出的题,说感觉这个热图很诡异,然后中间我自己没有用boxplot查看数据的表达量,对于数据不能有正确的认识,导致一开始的deg的logFC都没有达到正负1的,最重要...
示例数据:GSE139324有63个samples。https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE1393241...
单细胞数据挖掘实战:文献复现(一)批量读取数据[https://www.jianshu.com/p/c9da06d451b9]单细胞数据挖掘实战:文献复现(二)批量创建Seu...
单细胞空间转录组和单细胞分析类似,不可避免的会遇到多样本的问题,这就需要使用多样本整合分析策略Seurat提供了多张切片(slices)整合分析(Merge合并) 单细胞空间...
GO富集分析、KEGG富集分析和GSEA的区别 - 知乎 (zhihu.com)[https://zhuanlan.zhihu.com/p/481189718]https:/...