单细胞系列已经说了很多关于基因可视化的方法了。 单细胞基因可视化之小提琴图[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg5OTYzMzY5Ng==&...
IP属地：广西壮族自治区
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单细胞marker基因可视化的补充---密度图与等高线图
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单细胞marker基因展示值等高线密度图之前一个图的做法，是一篇《cell reports》上的文章，展示marker基因的表达的时候，添加上了等高线密度图，（参考：单细胞marker基因可视化的补充---密度图与...
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GSE83521/GSE89143去除批次效应老大在群里出的题，说感觉这个热图很诡异，然后中间我自己没有用boxplot查看数据的表达量，对于数据不能有正确的认识，导致一开始的deg的logFC都没有达到正负1的，最重要...
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Seurat包合并多个单细胞样本示例数据：GSE139324有63个samples。https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE1393241...
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单细胞数据挖掘实战：文献复现（六）标记基因及可视化单细胞数据挖掘实战：文献复现（一）批量读取数据[https://www.jianshu.com/p/c9da06d451b9]单细胞数据挖掘实战：文献复现（二）批量创建Seu...
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单细胞空间转录分析之Seurat-多样本整合（浅谈空间批次）单细胞空间转录组和单细胞分析类似，不可避免的会遇到多样本的问题，这就需要使用多样本整合分析策略Seurat提供了多张切片（slices）整合分析(Merge合并) 单细胞空间...
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GO,KEGG,GSEA区别（转）
GO富集分析、KEGG富集分析和GSEA的区别 - 知乎 (zhihu.com)[https://zhuanlan.zhihu.com/p/481189718]https:/...
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免疫基因查找(免疫基因预后模型)免疫基因查找 工具：IMMPORT 网址： https://www.immport.org[https://www.immport.org] 1、进入IMMPORT网址主页 ...
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探索肿瘤微环境中的细胞互作作者，Evil Genius~~~ 在多细胞生物中，细胞通过与其他细胞的交流来协调从早期发育到组织和器官成熟的各个方面。当它们不能正常交流时，疾病就会发生。在互作过程中，由细...
