转录组研究揭示盐碱胁迫下的分子调控机制 中国土壤的盐化与碱化成分复杂且程度各不相同,植物在长期进化过程中,从分子、细胞、生理生化水平等各个层面,形成了相应的机制来应对盐碱的胁...
上午,发生了一些事情。尽管,在意料之外,但我也早已做好准备。难免,心有波澜。 不过,平复平复后,我即开始工作。或许,这就是成长。 每天,我们总会遇到这样那样的事情,有时候我们...
写在前面:非常感谢CJ开发出如此强大的TBtools工具,作者详细讲解了基因家族的分析过程和意义,课程购买地址,讲的很棒,可以试听。 一共分为4个部分TBtools基因家族分...
前言:最近实验室要用northern-blot实验去检测miRNA的表达,对于多年没有设计过探针的我感到一丝恐慌,因为让人尴尬的是我把如何找一个基因表达的转录本也就是mRNA...
做富集分析的网页工具https://biit.cs.ut.ee/gprofiler/gost用法:把基因列表输入就可以了, 如果基因的重要性有区别就勾选 "ordered q...
开始期待👀
啥?在 windows 下用 samtools,对SAM排序得到Pos.Sorted.BAM ?写在前面 不出意外,6月,会把「TBtools」与群体遗传数据分析相关的系列插件,逐个释放。今天释放第二个,主要用于对 BAM 排序,同时支持 SAM / BAM / CRA...
写在前面 不出意外,6月,会把「TBtools」与群体遗传数据分析相关的系列插件,逐个释放。今天释放第二个,主要用于对 BAM 排序,同时支持 SAM / BAM / CRA...
请问怎么可视化成图表?
启动子顺式作用元件 之 PLACE数据库是怎么用的??写在前面:如果你不知道顺式作用元件是什么?请翻阅之前的文章:顺式作用元件的认识、查找、分析 正文在这:今天有一个小伙伴在公众号私信问我PLACE数据库怎么用 然而对于长期使用...
如何用MEGA-X构建进化树_生物研究_实用技巧_科研星球 (51xxziyuan.com)[https://www.51xxziyuan.com/54/1152.html]...
基因-共线性的定义与常见算法原理 物种内的共线性分析文件准备(物种比对到自身的.blast文件,物种基因信息文件.gff文件),运行MCScanX,输出collinear和t...
包括基因成员的序列特征分析(分子量等电点等)基于motif分析成员序列保守特征与可视化(蛋白与核酸,可用于挖掘未知,尤其是核酸水平-非编码水平的保守)基于domain分析成员...
放一张效果图,这些,三四年前的东西,我其实一直懒得说。 写在前面 “Gene Structure View (Advanced)”这个功能可以说,也是一时兴起写出来的。开发的...
写在前面 我受够了!整天有人问,TBtools怎么画这个图 但是我其实只想回一句: 你画这个图干什么?有什么意义?你想说谈什么生物学故事? 承认吧,你什么都不知道,什么都没搞...
实验中经常需要从基因组中提取、序列用于设计引物,或者进行基因功能研究等,之前看到别人使用的一个脚本,自己拿来用一下,感觉确实很方便 在网站[http://hgdownload...
你好,请问你的问题是怎么解决的呀
TBtools基因家族分析详细教程(3)基因家族成员的进化分析2基因-共线性的定义与常见算法原理 物种内的共线性分析文件准备(物种比对到自身的.blast文件,物种基因信息文件.gff文件),运行MCScanX,输出collinear和t...
很多基因家族个性化分析中,经常有基因motif+基因结构的看着还挺高大上的图片,小编接下来带你使用Tbtools做出这样的图片 准备作图文件 (1)根据gffread提取蛋白...
写在前面 TBtools 基本涵盖了基因家族分析所常见的所有分析与可视化功能,其中最为独特的 莫过于 Gene Structure View (Advanced) 几乎覆盖了...
早先写过,但是有不少朋友还是在后台留言,无法完全重复。我仔细看了之后发现,的确是我在有些细节上写的不够详细。但是不想去完善了。毕竟tbtools的实现逻辑已经很简单了。 那就...