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    计算SNPs间的连锁不平衡(LD,linkage disequilibrium)

    基本概念 连锁不平衡(LD,linkage disequilibrium)是指 不同基因座(loci)的等位基因(allele)之间非随机(nonrandom)的关联。 两个...

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    连锁不平衡(LD)分析。

    在群体遗传学研究中,LD连锁不平衡分析是非常常见的内容,同时也是关联分析的基础。在很多的遗传进化GWAS的文章中都会出现LD衰减或者block单倍型块的图。那么什么是连锁不平...

  • 利用plink对snp质控的指标和基本流程

    在拿到一组snp数据时,首先应该想到要对snp数据的质量进行检测和控制。然后再考虑这组数据该怎么分析,如何分析。snp的质控是非常重要的,如果snp数据的质量不佳,那么计算的...