写在前面 自2009年第一篇单细胞转录组文章发表以来，经过十多年的发展，各研究机构和生物公司相继推出单细胞RNA测序(scRNA-seq)服务，这使得单细胞测序已经从“王谢堂...
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非生信人员做单细胞数据分析的入门秘籍 -
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CADD药物设计、同源蛋白、分子对接
对接的过程中会考虑如下因素： 形状互补 亲疏水性 表面电荷分布 两种蛋白质-蛋白质分子对接： Rigid Docking 刚性对接–目前可用的大多数软件为刚性对接。 Flex...
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单细胞测序数据进阶分析—《拟时序分析》4.初识monocle3之前的课程我们已经对monocle2[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAwMzIzOTk5OQ==&mid=2247487400&idx=...
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细胞配受体通识以及常见细胞分泌信号通路你认为你的细胞只是简单的积木，无意识的和静态的，就像墙上的砖块?如果是的话，再想想!细胞能够探测到周围发生的事情，并且能够对来自邻居和环境的提示做出实时反应。此时此刻，你的细...
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Cellcall:单细胞数据细胞间通讯分析工具近日，做单细胞细胞间通讯分析，发现又有新的方法出现---cellcall，文章发表在Nucleic Acids Research杂志。 看了一下，这个方法相比于Cellcha...
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CellChat：细胞间相互作用分析利器前言 我们知道，细胞间信息传递方式一个是细胞表面配受体的相互作用，另一个通过细胞产生的可溶性小分子，即细胞因子。在单细胞数据分析中下游，有时候我们想看某几种细胞类型之间的相互...
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细胞通讯-2单个数据集进行细胞间通讯分析单个数据集分析，多个数据集比较分析，具有较大成分差异的数据集比较分析。本教程是单个数据集分析流程 此教程概述了使用 CellChat 的单个数据集对细胞通信网络进行推断、分析...
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10X scRNA免疫治疗学习笔记-6-marker基因的表达量可视化刘小泽写于19.10.18笔记目的：根据生信技能树的单细胞转录组课程探索10X Genomics技术相关的分析课程链接在：http://jm.grazy.cn/index/m...
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R语言常用配色大全R内置基本配色 R自带的grDevices包含有以下调色板： R中色彩相关的函数 使用RColorBrewer包配色 使用colorRampPalette()函数可以扩展颜色...
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Seurat4.0系列教程22：空间转录组的分析、可视化与整合Seurat4.0系列教程告一段落，但这决不是终点。这个系列教程是给大家打开一扇窗，让大家知道Seurat4.0有这些功能可用，少走弯路。后续还要自己深入研究。学，然后知不足...
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单细胞108篇文献解读之7---Single-cell RNA sequencing highlights the role of inflammatory cancer-associated ...
单细胞分析揭示iCAF亚群在膀胱癌治疗中的靶标作用作者：biogevin审稿：童蒙编辑：amethyst 我们在前面已经介绍过膀胱细胞的相关背景（认识膀胱细胞——单细胞水平比...
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公众号：TOP生物信息<br>B站：TOP菌<br>WeChat：TOPJUN996<br><br>top2读研，学习方向：癌症基因组、肿瘤免疫、单细胞组学
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不看私信<br>看不到的文章是被简书锁了
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免疫细胞注释-2：髓系细胞scRNAseq免疫细胞注释： 免疫细胞注释-1：T细胞[https://www.jianshu.com/p/0127c9b380c9] 免疫细胞注释-2：髓系细胞[http...
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细胞类型鉴定--单细胞marker基因（持续修正）细胞类型marker基因T CellsCD3D, CD3EThCD3D, CD3E, CD40LGTcCD3D, CD3E, CD8A, CD8BgdTTRDV2, TRGV...
