win11，在我更新完网络驱动牛客网就无法正常显示了，牛客网给我提示说是网络问题，让我修改DNS，但是按照他的方法修改之后还是没有恢复正常。 接着我就再次更新网络驱动，更新了...
发简信
IP属地：北京
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牛客网静态文件不正常显示 -
zotero国科大学位论文参考文献格式国科大学位论文格式要求和GB/T 7714—2015还有点不太一样，所以在zotero里不能直接找到符合要求的参考文献格式。不同所之间的格式可能也会有差别，我发现两种格式，一...
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安装R包phytools可以先尝试下面这两条命令： 在安装过程中如果提示ape包版本低需要更新，记得更新。如果R安装包退出状态的值不是0，可以换这个： 一般都能安装成功，但是我安装成功之后libra...
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Stay hungry, Stay foolish
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海外博士申请总结 - 准备材料之个人陈述篇本文唯一作者为Bright新人类，如需转载，请先发简信通知谢谢 在上一篇文章中，我们详细介绍了博士申请过程中简历如何撰写以及具体可以通过什么平台来撰写简历， 希望能给你一些参...
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一条小咸鱼
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最大简约法（Maximum Parsimony）选择最优树——NP-complete问题 （以下内容都是基于Christopher P. Randle教授在研究组上交流时的课件整理而来。感谢Christopher。） 在介...
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无法与服务器建立连接: 未能下载 VS Code 服务器(Server returned 404).这个问题折腾了两个小时，看了这位仁兄的文章才知道问题在哪儿 我只教一次！vscode remote-ssh 连接失败的基本原理和优雅的解决方案 - 知乎 (zhihu.com...
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第九章 魏斯曼与老鼠的尾巴
拉马克，一个在生物进化理论历史上很憋屈的人，不论在生前还是生后。 他比达尔文更早提出进化论，但是，他的“用进废退”、“获得性状遗传”进化学说大多数时间里受到达尔文的“随机变异...
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rgene_gamma计算2023-10-02rgene_gamma计算，准备如下两个文件，以及ctl配置文件 树文件：请注意，根节点需要一个简单的化石校准，比如“@4.5”（450Ma ago）。如果没有这个标记计算出...
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伽马速率分布类别gamma distributed rate categories (+G), and不变速率类别 an invariant category (+I)
Prottest进行氨基酸替代模型预测
首先，氨基酸替代模型是什么我现在还不知道，希望有一天能摸索出来 万事开头难之下载 要挂个梯子https://github.com/ddarriba/prottest3/rel...
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Prottest进行氨基酸替代模型预测首先，氨基酸替代模型是什么我现在还不知道，希望有一天能摸索出来 万事开头难之下载 要挂个梯子https://github.com/ddarriba/prottest3/rel...
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你把log文件删去重新跑应该就可以了
IQTREE 使用记录
什么是iqtree？ iqtree是一款构建进化树的软件，类似于phyml，raxml。文章地址：W-IQ-TREE: a fast online phylogenetic ...
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常见组蛋白修饰要点汇总常见组蛋白修饰的功能、作用位点以及数据分析中信号呈现的峰形： 组蛋白修饰的功能大致分成两类：活化，对基因的转录表达起促进作用；阻遏，对基因的转录起抑制作用，典型的代表为H...
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安装R包treedataverse
发现网上没有安装treedataverse的教程，只有简单的一句 但我一直报错，更新依赖包也会有些包出现Permission denied的情况，比如： 尝试重启Rstudi...
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R绘制优美的进化树（基础）这篇文章主要是介绍绘制进化树用的ggtree以及一些拓展包的基础用法，因为gg系列绘图的逻辑基本是搭积木，这种介绍性的文章能够帮助快速的找到想要的“积木”以及拼接的方法，剩下...
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生信博士生一枚，分享科研代码，经验。推文一般很长，努力将一个问题讲全面，感谢你的耐心阅读。
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中山大学中山医学院-基础医学博士在读<br>欢迎关注个人公众号<br><br>公众号：bioinfomics<br>博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fdongwei1220.github.io%2F" target="_blank">https://dongwei1220.github.io/</a><br>
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如何用PPT设计绘制一个分割型圆弧图缘起：看到这样一张PPT，大家有没有想过这个分割型的圆弧的形状是怎么做成的呢？ 首先我想到的是插入形状，但是我去形状里面找啊找，也没有找到这样的形状啊。那只能另辟蹊径了。 第...
