240 发简信
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  • 洲更,你的博客刷新太慢了,影响体验。有没有什么办法提高一下?

    「基因组组装」三代组装多少深度比较合适

    一句话总结,组装深度建议高于30X,N50建议高于11Kb,否则会出现严重的片段化。 最初参加三代组装培训的时候,课程老师建议Canu使用所有数据进行组装会比较好。因为我组装...

  • liftOver进行不同版本染色体位置转换

    人类基因组计划启动20年,目前出了很多基因组版本2013年的GRCh38/hg38 (最新)2009年的GRCh37/hg19 (常用)2006年的GRCh36/hg18...

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    SRA 数据下载自救指南

    还在羡慕海峡那边的朋友下载SRA 快到飞起?还在难过用wget 下载数据经常下载不完整?用了官方的下载工具还是慢的不行?这里有一个SRA 下载自救尝试指南供你参考。 需要用到...

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    无参转录组序列组装 — Trinity

    转录组分析策略 转录组分析策略根据有无参考转录组可以分为两类: 有参比对—定量—差异分析—功能富集分析等 无参组装—定量—差异分析—功能富集分析等image 无参考转录组序列...

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    smart-seq2 实践

    单细胞转录组:smart-seq2 参考资料: Smart-seq2 scRNA小鼠发育学习笔记: https://www.jianshu.com/p/23a8fcb1292...

  • 2020-05-02

    awk实现两个文件的合并文件A:12 ab we h的34 bf dwd d丰富56 dejw csc 而从容文件B:12 ddd de 得分34 ede ee...

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    关于unique mapped reads

    如下图,是tophat2比对完之后的结果 1、bowtie2XS:i: Alignment score for the best-scoring alignment fou...

  • 如何获取sam文件中序列比对到哪条链,FLAG信息解读

    转载自嘻皮悠的博客 http://blog.sina.com.cn/u/2054060511————————————————————————————————————————...

  • 这是在哪里呀

    不负春光不负卿

    难得有心情看看朋友圈,刷屏的油菜花美图,已经是两天前的日期,心里才想起我也该好好看看那片花海了。不然一不留神就错过了花期,看了,也算是将短短的油菜花期在记忆里延长一些吧。 所...

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    不负春光不负卿

    难得有心情看看朋友圈,刷屏的油菜花美图,已经是两天前的日期,心里才想起我也该好好看看那片花海了。不然一不留神就错过了花期,看了,也算是将短短的油菜花期在记忆里延长一些吧。 所...

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    fragement/reads, insert size/fragement size 的区别

    fragement是reads 比对参考序列时,得知与其pair的另一条reads是否也比对上这个位置,这两条互相配对的reads就是fragement。insert siz...

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    学习笔记

    2019.10.1添加环境变量:永久式:1.echo $PATH 3. source ~/.bashrc #source 命令使该文件立即生效;如果不source,需要在下...

  • 不行啊

    CCProxy8.0详细安装破解教程(附序列号生成器,全网独家可用)

    免责声明:软件仅供技术交流,请勿用于商业及非法用途,如产生法律纠纷与本人无关。如侵犯版权,请留言,本人立即删除!!强烈建议购买正版!!! CCProxy安装破解教程,附注册机...

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    RNA-seq数据分析---方法学文章的实战练习

    前言 这次给大家带来的是16年发表在NATURE PROTOCOLS上面的一篇处理RNA-seq数据的文章:Transcript-level expression analy...