我们一起舔过铁栏杆

环形图大家都会绘制，但如何绘制出这种分段的环形图表达呢？ 我们赶紧给大家show一下制作肌肉。相信大部分小伙伴都想到先画一个环形，但其实牛闪闪觉得先画下面的图形最先，上图的环...

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Smart-seq2 Smart-seq是由路德维格癌症研究所的 Rickard Sandberg实验室[http://sandberg.cmb.ki.se/]所开发的一套在...

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这次跟着课程（Smartseq2 scRNA小鼠发育学习笔记-1-前言及上游介绍）要练习的文章是：Dissecting Cell Lineage Specification ...

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本期内容同步发布于单细胞天地微信公众号。 回顾——细胞通讯网络构建 前面的帖子中我们已经成功地进行了细胞间通讯网络的构建，总的来看借助下面简易的分析流程即可完成： 今天继续介...

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常用的细胞通讯软件：CellphoneDB[https://www.jianshu.com/p/38a9376f5286]：是公开的人工校正的，储存受体、配体以及两种相互作用...

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0.背景知识 参考地址：https://bioconductor.org/help/course-materials/2005/BioC2005/labs/lab01/bet...

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最近在做一个分析的时候，需要使用到python，而我的单细胞数据是seurat对象，所以需要转化一下，变成h5ad。关于seurat转h5ad的方法，我们在PAGA那一部分进...

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之前我们复现了一篇文章的GSEA图（（更新）复现Cell子刊图表：GSEA多组结果可视化函数[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg5OTYz...

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在非监督的单细胞数据分析中，给定细胞cluster的均一性往往是不清楚的，也就是说我们并不知道分出的一个cluster中是否是一种细胞，还是依然包含了多种细胞。因此有人提出了...

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RStudio Server是网页版的RStudio，相比于单机版，它的灵活性更强，部署在服务器上后，可随时随地完成R语言的工作。并且能很方便的完成R项目的部署调试。本文介绍...

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前一篇推送解读了今年发在NG上的鉴定玉米抗旱基因的文章。文章中一个比较关键的分析是从泛基因组水平鉴定结构变异。作者应用并评估了四款常用的软件：SyRi、Smartie-sv、...

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本文的部分内容来源于“Comprehensive evaluation and characterisation of short read general-purpose ...

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说在前面 我们在前面通过3篇推文介绍了张泽民老师的系列研究成果张泽民老师系列文章解读(一)[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4MjY5...