Hayley笔记

在读张泽民老师发表的新冠文献的时候看到计算免疫细胞的cytokine score或inflammatory score使用了Seurat包的AddMouduleScore函数...

单细胞空间交响乐

作者，Evil Genius 看到最近的反馈，大家似乎对相亲的事情很感兴趣啊，😄，但是大家别光顾笑啊，女孩子想想自己30多岁会不会也是这样，男孩子30多了想想遇到这样的女人该...

单细胞空间交响乐

作者,Evil Genius 新的一年,对于单细胞空间来讲,一开始就是被Visium HD抢走了风头,各个公司的推文铺天盖地而来,我的第一反应是,华大空间平台问世的时候,国内...

jjjscuedu

下面这个图是我在单细胞相关文章中见过的，也算是火山图的变种。可以看出X轴是不同的细胞类型，Y轴是marker基因的fold change（log2）,但是不同类别之间他们是不...

Hayley笔记

单细胞绘图系列： Seurat绘图函数总结[https://www.jianshu.com/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2优化Seurat绘图[https...

清竹饮酒

什么是拟时序分析？拟时序（pseudotime）分析，又称细胞轨迹（cell trajectory）分析，通过拟时分析可以推断出发育过程细胞的分化轨迹或细胞亚型的演化过程。我...

云养江停

有人可能会说：单细胞分析使用Seurat，monocle等R包会更加方便。但是实际分析中,测试情况是当细胞量大于5万时。一般小型服务器内存很容易不足，这时候请不要过多尝试使用...

Bio_Infor

本期内容已同步分享至单细胞天地 细胞通讯是指细胞与细胞之间的联系。细胞和人类一样，多细胞生物的很多细胞会相互作用，形成“细胞社会”，在这个社会里，细胞与细胞之间会发生相互作用...